Fluoreszenzfarbstoffe – Ihr Assay - Ihre Sonde

5'
Int
3'

Multicolour Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung/FISH

Die grundsätzlichen Charakteristiken der Alexa Fluor Farbstoffe von Molekular Probes sind

• helle photostabile Fluoreszenz
• gute Wasserlöslichkeit
• pH-unempfindlich zwischen pH 4 bis 10
• hohe Quantenausbeuten und lange Fluoreszenzlebensdauer

5'
Int
3'

FRET
Multicolor Detektion
Imaging Anwendungen
In-situ Hybridisierung/FISH
Fluoreszenzmikroskopie

DY-415 ist ein Teil der Dyomics Fluoreszenzfarbstoffe der Firma Dyomics GmbH.

Die hervorragenden Charakteristiken der Dyomics Farbstoffe sind

• hohe Extinktions-koeffizienten
• hohe Fluoreszenzquanten-ausbeute
• großer Stokes-Shift
• hohe Stabilität gegenüber Photobleaching

5'
Int
3'

Multicolour Detektion
Imaging Anwendungen
In-situ Hybridisierung/FISH
Fluoreszenzmikroskopie

ATTO 425 ist ein neuartiger Fluoreszenzmarker der Firma ATTO-TEC GmbH.

Charakteristische Merkmale dieses Farbstoffes sind

• hohe Fluoreszenzquanten-ausbeuten
• großer Stokes-Shift
• hohe Photostabilität
• niedriges Molekulargewicht

ATTO 425 ist mäßig hydrophil.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 405-455 nm.

5'
Int
3'

FRET
Multicolour Detektion
Imaging Anwendungen
In-situ Hybridisierung/FISH
Fluoreszenzmikroskopie

ATTO 465 ist ein neuartiger Fluoreszenzmarker der Firma ATTO-TEC GmbH.

Charakteristische Merkmale dieses Farbstoffes sind

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquanten-ausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität

In wässriger Lösung zeigt der Farbstoff einen unerwartet großen Stokes-Shift von 55 nm.

ATTO 465 ist mäßig hydrophil.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 420-465 nm.

5'
Int
3'

FRET
Ummunologische Nahweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Bodipy FL ist Teil der Bodipy Familie von Molecular Probes.

Die Merkmale dieser Farbstoffe sind

• geringe Anfälligkeit gegenüber Photobleaching
• hohe Signalintensität

CY2
DY-495
ATTO 495

5'
Int
3'

Multicolor Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung/FISH

Die Eigenschaften von Alexa Fluor 488 von Molecular Probes sind

• spektrale Eigenschaft nahezu identisch zu Fluoresceine
• Fluoreszenz-Lebensdauer von ~ 4,1 Nanosekunden
• starke Absorption, mit einem Extinktionskoeffizienten von 71.000 cm-1M-1
• hohe Photostabilität
• pH-unempfindlich zwischen pH 4 und 10

5'

6-FAM (6-Carboxyfluorescein) ist der am häufigsten verwendete Fluoreszenzfarbstoff für die verschiedensten Anwendungen.

Es hat die gleichen spektralen Eigenschaften wie Fluoresceine und FITC und besitzt eine hohe Quantenausbeute.

FAM ist mit fast allen Fluoreszenzdetektionssystemen kompatibel und sollte in einem pH-Bereich von 7.5-8.5 eingesetzt werden.

5'
Int
3'

Multicolor Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung / FISH

FITC ist die Abkürzung für Fluoresceinisothiocyanat.

Die Fluoreszenz dieses Moleküls ist sehr hoch und kann an beliebiger Stelle eines Oligonukleotids eingebaut werden.

Es ist ein Derivat des Fluoresceins mit einem Isothiocyanat-Gruppe.

Es hat die gleichen Absorptionsspektren wie Fluorescein und FAM.

3'

Real-time PCR, FRET
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Fluorescein wird im vergleich zu FITC und FAM ausschließlich für die 3'Markierung am Oligo angeboten.

Es blockiert die terminale OH-Gruppe des Oligomers. Fluorescein ist bekannt für seine

• Instabilität gegenüber Photobleaching
• natürliche Hintergrundsfluoreszenz bei 480-530nm

Daher wird Fluorescein häufig in Anwendungen wie FISH durch stabilere Farbstoffe wie zum Beispiel Oregon Green™ ersetzt.

3' Fluorescein wird bevorzugt als Donor-Farbstoff in FRET-Systemen oder als Alternative zu Digoxigenin und Biotin in immunologischen Nachweisverfahren eingesetzt.

472,71

DY-495
ATTO 495

Fluorescein-dT wird im Vergleich zu Fluorescein, FITC und FAM für die interne Markierung eines Oligos angeboten.

Dies geschieht mittels der Desoxy-Gruppe der Thymidin Basis (-DT) und kann daher als modifizierter Primer verwendet werden.

Fluorescein-dT is bekannt für seine

• Instabilität gegenüber Photo-Bleaching
• natürliche Hintergrundsfluoreszenz bei 480-530nm

Daher wird Fluorescein häufig in Anwendungen wie FISH durch stabilere Farbstoffe wie zum Beispiel Oregon Green ersetzt.

Fluorescein-dT kann als Alternative zu Digoxigenin und Biotin-dT in immunologischen Nachweisverfahren eingesetzt werden.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 488 ist ein neuartiger Fluoreszenzfarbstoff der Firma ATTO-TEC GmbH.

Zu den charakteristischen Eigenschaften dieses Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe photochemische Stabilität
• sehr wenig Triplett Bildung
• hervorragende Wasserlöslichkeit

Die effizienteste Anregung erfolt im Bereich 480-515 nm zum Beispiel mit einem Agron-Ionen-Laser bei 488nm.

5'
Int
3'

Laser-Scanning-Mikroskopie
Flow Cytrometry
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Oregon Grenn Farbstoffe sind von Molecular Probes.

Das Absorptionsspektrum von Oregon Green 488 entspricht ungefähr dem des Fluoresceines allerdings mit

• verbesserter Photostabilität
• geringerer pH Empfindlichkeit

5'
Int
3'

Laser-Scanning-Mikroskopie
Flow Cytrometry
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Oregon Green Farbstoffe sind von Molecular Probes.

Das Absorptionsspektrum von Oregon Green 514 entspricht ungefähr dem des Fluoresceines allerdings mit

• verbesserter Photostabilität
• geringerer pH Empfindlichkeit

5'
Int
3'

Laser-Scanning-Mikroskopie
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Die charakteristischen Eigenschaften von Rhodamin Green von Molecular Probes sind

• ein hoher Extinktionskoeffizienten
• eine hohe Quantenausbeute
• seine Photostabilität

Die Interaktion zwischen dem Farbstoff und des Oligos wird durch den C7-Aminolink reduziert.

5'

DNA Sequenzierung / Fragment Analyse
Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
SNP-Nachweis / Genotypisierung

TET ist die Abkürzung für 5-Tetrachloro-Fluoresceine, ein Phosphoramidit von Applied Biosystem.

TET ist ein äußerst stabiler Farbstoff. Seine Einsatzmöglichkeiten sind begrenzt durch das nahe Emissionsspektrum zu FAM.

TET wird häufig als 5' Fluorophor in Dual Labeled Probes und Molecular Beacons oder als 5' markierter Primer für verschiedenste Applikationen mit ABI Instrumenten eingesetzt.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

Spezifikation

ATTO 520 ist ein neuartiger Fluoreszenzfarbstoff der Firma ATTO-TEC GmbH, der mit dem bekannten Rhodamine 6G verwandt ist.

Zu den charakteristischen Eigenschaften dieses Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität´

Der Farbstoff ist mäßig hydrophil. Die effizienteste Anregung erfolgt im Bereich 510-535 nm zum Beispiel mit einem Argon-Ionen-Laser bei 514nm.

5'
INT
3'

DNA Sequenzierung / Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung / FISH-Mikroskopie
Genexpressionsanalysen
SNP-Nachweis / Genotypisierung

6-JOE ist ein 6-carboxy-4'5'-dichloro-2',7'-dimenthoxyfluorescein. Als NHS Ester kann dieser Farbstoff an amino-modifizierten Oligonukleotiden an jede Position gekoppelt werden. Als 5' -Modifikation wird der Farbstoff als Amidit mit einem Cyclohexyl-Linker verwendet.

6-JOE hat ähnliche Absorptions- und Emissionsspektren wie der Farbstoff Rhodamin 6G.

JOE wird traditionell als Fluorophor in der DNA Sequenzierung und als Reporter Farbstoff in der Multiplex Real-Time qPCR eingesetzt.

5'

DNA Sequenzierung / Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH Mikroskopie

Yakima Yellow ist ein exklusiver Farbstoff hergestellt und verkauft unter der Lizenz von Epoch Biosciences, Inc. Er ist die beste Alternative zum VIC Farbstoff von Applied Biosystems.

Yakima Yellow ist ein idealer Farbstoff, da er in jedem Nachweissystem, das FRET beinhaltet, verwendet werden kann.

Yakima Yellow markierte Oligonukleotide sind ausschließlich für Forschungszwecke zu verwenden und sollten nicht für kommerzielle, klinische oder dagnostische Zwecke eingesetzt werden.

5'
INT
3'

FRET
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Bodipy 530/550 ist Teil der Bodipy Familie von Molecular Probes.

Die Merkmale dieser Farbstoffe sind

• geringe Anfälligkeit gegenüber Photobleaching
• hohe Signalintensität

5'
INT
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
Fluss-Cytometrie
FISH-Microscopie

ATTO 532 ist ein neuartiger Fluoreszenzfarbstoff der Firma ATTO-TEC GmbH, der mit dem bekannten Rhodamine 6G verwandt ist. Zu den charakteristischen Eigenschaften dieses Farbstoffs zählen:

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe photochemische Stabilität
• sehr gute Löslichkeit in Wasser

5'

DNA Sequenzierung / Fragmentlängenanalyse
Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung / FISH-Mikroskopie
SNP Detektion / Genotypisierung

HEX ist die Abkürzung von Hexachloro-Fluoresceine, ein Phosphoramidit von Applied Biosystems.

HEX wird im Allgemeinen als 5' Fluorophor für Dual Labelded Probes und Molecular Beacons oder als 5' markierter Primer für die verschiedensten Applikationen auf ABI Instrumenten eingesetzt.

Das Phosphoramidit ist bereits relativ instabil in der Produktion.

HEX markierte Primer sind sehr hydrophob was die Effizienz der PCR beeinflussen kann. Daher wird HEX bereits in einer Vielzahl von Applikationen durch Yakima Yellow ersetzt.

5'
INT
3'

Multicolour Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung / FISH

Die Spezifikationen von Alexa Fluor 555 von Molecular Probes zeichnen sich aus durch

• ähnliche spektralen Eigenschaften wie die von Tetramethylrhodaminen (TRITC, TMR TAMRA) und Cy3
• optische Filter, die für Cy3 verwendet werden, funktionieren auch mit Alexa Fluor 555
• höhere Photostabilität als Cy3
• bessere Stabilität gegenüber Photobleaching als Alexa Fluor 546

544

5'
INT
3'

FRET
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Bodipy TMR-X ist Teil der Bodipy Familie von Molecular Probes.

Die Merkmale dieser Farbstoffe sind

• geringe Anfälligkeit gegenüber Photobleaching
• hohe Signalintensität

5', 3', intern

Microarray-Experimente
Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie
DNA Sequenzierung

Cyanine3 ist ein reaktiver wasserlöslicher Fluoreszenzfarbstoff.

Die Carakteristika von Cyanine3 sind

• hervorragende spektrale Eigenschaften
• hohe Quantenausbeute
• hoher Extinktionskoeffizient
• gute Fluoreszenzstabilität gegenüber pH-Veränderungen unter verschiedenen Pufferbedingungen

Die Fluoreszenz liegt im tief-gelben Bereich.

5', 3', intern

DNA Nanotechnologie

Cyanine3B ist ein neuer Fluoreszenzfarbstoff aus der Cyanine Familie.

Die Carakteristika von Cyanine3B sind

• Hervorragende Fluoreszenz
• Gute Wasserlöslichkeit
• Hoher Extinktionskoeffizient

Die Fluoreszenz liegt im tief-gelben Bereich.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 550 ist ein neuartiger Fluoreszenzmarker der ATTO-TEC GmbH, artverwandt zu den Farbstoffen Rhodamin 6G und Rhodamin B.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquanten-ausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität

Der Farbstoff ist mäßig hydrophil. Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 540-565 nm.

5'
3'

DNA Sequenzierung / Fragment Analyse
Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung / FISH-Mikroskopie
SNP-Nachweis / Genotypisierung

TAMRA ist eine Abkürzung für Carboxy-Tetramethyl-Rhodamine der Firma Applied Biosystems.

Er kann sowohl als 5' Fluoreszenzmarkierung für die Fluoreszenzmikroskopie oder DNA Sequenzierung auf ABI Analyzern, als auch als 3' Quencher für kurzwellige Reporter-Farbstoffe verwendet werden.

Ext. Koeff.

5'
Int
3'

Multicolor Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung / FISH

Rhodamine Red von Molecular Probes wird gerne als zweiter Farbstoff in Kombination mit anderen Fluoreszenzfarbstoffen eingesetzt.

Rhodamine Red ist bekannt für

• einen hohen Extinktionskoeffizienten
• eine hohe Quantenausbeute
• eine höherer Photo-Stabilität als Rhodamin B

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 565 ist ein neuartiger Fluoreszenzmarker der ATTO-TEC GmbH und gehört zu der Familie der Rhodaminfarbstoffe.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität

Der Farbstoff ist mäßig hydrophil. Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 545-575 nm.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR

ATTO RHO12 ist ein neuartiger Rhodamin-Farbstoff aus der ATTO Familie der Firma ATTO-TEC GmbH. 

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• Starke Absorption
• Hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• Hohe photochemische Stabilität

Der Farbstoff ist mäßig hydrophil.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 550 - 580 nm.

5'
Int
3'

DNA Sequenzierung / Fragment Analyse
Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
Genexpressionsanalysen
SNP-Nachweis / Genotypisierung

ROX ist die Abkürzung für Carboxy-X-Rhodamine von Applied Biosystems.

Dieser Ester ist ein roter Fluoreszenzfarbstoff, der durch einen Amino-Linker an das Oligo gekoppelt wird. Demzufolge kann ROX nicht mit anderen Ester-Farbstoffen kombiniert werden-

ROX ist Mitglied der Rhodamine Familie.

Im Gegensatz zu Fluoresceinen sind Rhodamine-Farbstoffe über einen größeren pH-Bereich stabil und stabiler gegenüber Photobleaching.

Das relativ langwellige Emissionsmaximum macht ROX zu einem attraktiven Farbstoff für Multiplex-Detektionssysteme.

Seine spektralen Eigenschaften sind vergleichbar mit Texas Red.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Mi
Genexpressionsanalysen
SNP-Nachweis / Genotypisierung

TexasRed ist ein häufig verwendeter Farbstoff von Molecular Probes.

Seine spektralen Eigenschaften sind vergleichbar mit ROX. Dieser ausschließlich als Ester erhältliche rote Fluoreszenzfarbstoff wird durch einen Amino-Linker an das Oligo gekoppelt. Demzufolge kann er nicht mit anderen Ester-Farbstoffen kombiniert werden.

Texas Red wird aufgrund seiner geringen spektralen Überlappungen zu anderen Farbstoffen gerne als dritter Farbstoff in speziellen Anwendungen wie Multiplex-PCR verwendet. Er kann auch als 5' Reporter in FRET-Systemen oder einfach als Alternative für ROX verwendet werden.

5'

Microarray Experimenten
Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie
Multicolor Detektion

Cyanine 350 ist ein wasserlöslicher Fluoreszenzfarbstoff.

Die charakteristischen Merkmale von Cyanine 350 sind

• ein hoher Extinktionskoeffizient
• gute pH-Stabilität in verschiedenen Pufferbedingungen
• Absorption im orangenen Bereich

Cyanine 350 ist eine alternative Modifikation in Multicolor Experimenten.

5'
Int
3'

FRET, real-time PCR, qPCR
SNP-Nachweis
Alles-Diskriminierung
Endpunktbestimmung

LightCycler Red 610 ist ein NHS-Ester produziert und patentiert von Roche Diagnostics GmbH.

Dieser Farbstoff wird für die 5' Markierung von LightCycler Probes für LightCycler Instrumente verwendet.

Das 3'-Ende der Sonde muss zusätzlich mit einem C3-Spacer oder Phosphat blockiert werden, um eine Elongation während der PCR zu vermeiden.

5'
Int
3'

Multicolor Detektion
Imaging-Anwendungen
In-situ Hybridisierung / FISH
Fluoreszenzmikroskopie

ATTO 594 ist ein neuartiger Fluoreszenzmarker von ATTO-TEC GmbH, und gehört zu der Familie der Rhodaminfarbstoffe. Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität und
• ausgezeichnetes Wasserlöslichkeit

ATTO 594 ist ser hydrophil. Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt imm Bereich 580-615 nm.

5'
Int
3'

Microarray Experimenten
FISH-Mikroskopie
Gel-Elektrophorese

DY-480 XL gehört zu der sogenannten Megastoke Familie produziert von der Dyomics GmbH. Megastoke Farbstoffe weisen einen starken Stokes-Shift auf.

Diese Farbstoffe können in qPCR-Sonden auf LightCycler Real-time Instrumenten eingesetzt werden.

Megastoke Farbstoffe zeichnen sich wie alle Dyomics Farbstoffe durch folgende Eigenschaften aus:

• hohe Extinktionskoeffizienten
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe Stabilität gegenüber Photo-Bleaching

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Multicolor Detektion
Imaging-Anwendungen
In-situ Hybridisierungen / FISH
Fluoreszenzmikroskopie

DY-610 ist ein Teil der Dyomics Fluoreszenzfarbstoffe der Firma Dyomics GmbH.

Die hervorragenden Charakteristiken der Dyomics Farbstoffe sind

• hohe Extinktions-koeffizienten
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• großer Stokes-Shift
• hohe Stabilität gegenüber Photo-Bleaching

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 610 gehört zu einer neuen Generation von Fluoreszenzfarbstoffen von ATTO-TEC speziell entwickelt für den roten Spektralbereich.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität

ATTO 610 ist mäßig hydrophil.

ATTO 610 ist in pH-Bereichen bis pH 8.5 sehr stabil.

Er degeneriert langsam ab höheren pH Werten.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 595 - 625 nm.

5'
Int
3'

FRET, real-time PCR
SNP detection
Allel-Diskriminierung
Endpunktbestimmung

LightCycler Red 640 ist ein NHS-Ester produziert und patentiert von Roche Diagnostics GmbH.

Dieser Farbstoff wird für die 5' Markierung von LightCycler Probes für LightCycler Instumente verwendet.

Das 3'-Ende der Sonde muss zusätzlich mit einem C3-Spacer oder Phosphat blockiert werden, um eine Elongation während der PCR zu vermeiden.

5'
Int
3'

FRET
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Bodipy 630/650 ist Teil der Bodipy Familie von Molecular Probes.

Die Merkmale dieser Farbstoffe sind

• geringe Anfälligkeit gegenüber Photobleaching
• hohe Signalintensität

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 633 gehört zu einer neuen Generation von Fluoreszenzfarbstoffen von ATTO-TEC speziell entwickelt für den roten Spektralbereich.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität

Absorption und Fluoreszenz sind unabhängig von pH-Wert, zumindest in dem Bereich von pH 2 bis 11.

ATTO 633 ist mäßig hydrophil.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 610 - 645 nm.

Eine für ATTO 633 geeignete Anregungsquelle ist z.B. ein HeNe-Laser bei 633 nm oder ein Diodenlaser bei 635 nm.

5'
Int
3'

Multicolor Detektion
FRET
Fluoreszenzmikroskopie
In-situ Hybridisierung / FISH

Die Spezifikation von Alexa Fluor 647 von Molecular Probes sind

• nahezu identische spektrale Eigenschaften wie von Cy5
• die Photostabilität und Fluoreszenz, die in der Regel die von Cy5 übersteigt
• angemessene Wasserlöslichkeit

5'
Int
3'

FRET
Immunologische Nachweise
In-situ Hybridisierung
Fluoreszenzmikroskopie

Bodipy 650/665 gehört zu der Bodipy Famile von Molecular Probes-

Die charakteristischen Merkmale von Bodipy's sind

• geringe Anfälligkeit gegenüber Photobleaching
• eine hohe Signalstärke

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Microarray-Experimenten
Mikrosatteliten-Analyse
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 647N gehört zu einer neuen Generation von Fluoreszenzfarbstoffen von ATTO-TEC speziell entwickelt für den roten Spektralbereich.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität
• außergewöhnlich hohe Stabilität gegenüber atmosphärischem Ozon

Absorption und Fluoreszenz sind pH-unabhängig im Bereich von pH 2-11. Der Farbstoff ist mäßig hydrophil.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 625-660 nm.

Für den Farbstoff geeignete Anregungslichtquellen sind Krypton-Ionen-Laser (647 nm) oder gängige Diodenlaser (650 nm).

5', 3', intern

Real-time PCR, qPCR, FRET
Microarray Experimenten
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie
DNA Sequenzierung

Cyanine5 ist ein reaktiver wasserlöslicher Fluoreszenzfarbstoff.

Die Charakteristika von Cyanine5 sind

• hervorragende spektrale Eigenschaften
• hohe Quantenausbeute
• hoher Extinktionskoeffizient
• gute Fluoreszenzstabiltiät gegenüber pH-Veränderungen unter cerschiedenen Pufferbedingungen

Die Fluoreszenz liegt im roten Bereich.

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Multicolor Detektion
Imaging-Anwendungen
In-situ Hybridisierung / FISH
Fluoreszenzmikroskopie

DY-649 ist ein Teil der Dyomics Fluoreszenzfarbstoffe der Firma Dyomics GmbH.

Die hervorragenden Charakteristiken der Dyomics Farbstoffe sind

• hohe Extinktionskoeffizienten
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• großer Stokes-Shift
• hohe Stabilität gegenüber Photobleaching

Alexa Fluor 690
TYE 705

5'

Microarray Experimenten
Real-time PCR, qPCR, FRET
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

Cyanine 550 ist ein reaktiver wasserlöslicher Fluoreszenzfarbstoff.

Die Charakteristika von Cyanine 550 sind

• hoher Extinktionskoeffizient
• gute pH-Stabilität in verschiedensten Pufferbedingungen
• Absorption im orangenen Bereich

Cyanine 550 kann als alternative Modifikation in multicolor Experimenten eingesetzt werden.

Alexa Fluor 680
Alexa Fluor 700

5'
Int
3'

Real-time PCR, qPCR, FRET
Microarray-Experimenten
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 680 gehört zu der neuen Serie von Fluoreszenzfarbstoffen von der ATTO-TEC GmbH.

Charakteristische Eigenschaften von ATTO 680 sind

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• hohe thermische und photochemische Stabilität
• gute Wasserlöslichkeit

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 625-660 nm.

Für den Farbstoff geeignete Anregungslichtquellen sind Krypton-Ionen-Laser (676 nm) oder gängige Diodenlaser (670 nm).

5'
INT
3'

DNA Sequenzing
AFLP Analyse
TILLING
Mikrosatteliten-Analyse

DY-682 ist ein Teil der Dyomics Fluoreszenzfarbstoffe der Firma Dyomics GmbH. Die hervorragenden Charakteristiken der Dyomics Farbstoffe sind

• hohe Extinktionskoeffizienten
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• großer Stokes-Shift
• hohe Stabilität gegenüber Photobleaching

5'
INT
3'

Aufreinigung

DNA Sequenzierung
AFLP Analyse
TILLING
Mikrosatteliten-Analyse

ATTO 700 gehört zusammen mit ATTO 655 und ATTO 680 zu einer neuen Generation von langweilligen Fluoreszenzmarkern.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffts zählen

• starke Absorption
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• gute Wasserlöslichkeit
• hohe thermische und photochemische Stabilität

ATTO 700 ist ein guter Elektronenakzeptor.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 670-715 nm.

Cy7
Alexa Fluor 740

5'
Int
3'

Aufreinigung

Real-time PCR, qPCR, FRET
Microarray-Experimenten
In-situ Hybridisierung
FISH-Mikroskopie

ATTO 740 gehört zu einer neuen, speziell von der ATTO TEC GmbH entwickelten Generation von Fluoreszenzmarkern für den nahen infrarot Spektralbereich.

Zu den charakteristischen Eigenschaften des Farbstoffs zählen

• starke Absorption
• gute Fluoreszenzquantenausbeute
• ausgeszeichnete thermische und photochemische Stabilität

ATTO 740 ist imm pysiologischen pH-Bereich und in Puffern bis pH 7,5 stabil. in alkalischer Lösung ist, pH-abhängig, langsame Zersetzung zu beobachten.

Eine effiziente Anregung der Fluoreszenz erfolgt im Bereich 720-755 nm.

5'
INT
3'

DNA Sequenzierung
AFLP Analyse
TILLING
Mikrosatteliten-Analyse

DY-782 ist ein Teil der Dyomics Fluoreszenzfarbstoffe der Firma Dyomics GmbH.

Die hervorragenden Charakteristiken der Dyomics Farbstoffe sind

• hohe Extinktionskoeffizienten
• hohe Fluoreszenzquantenausbeute
• großer Stokes-Shift
• hohe Stabilität gegenüber Photobleaching