MGB-Eclipse Sonden für die 5' Nuklease Real-Time PCR
MGB-Sonden von Eurofins Genomics stabilisieren die Sonden-Target-Hybridisierung und erhöhen die Schmelztemperatur.
Unsere MGB-Sonden enthalten einen 5' Fluoreszenz Farbstoff und einen 3' Eclipse Quencher der an dem MGB-Molekül gekoppelt ist.
Produktspezifikationen:
- Erhältlich in den Mengen 5 nmol, 20 nmol und 40 nmol
- Sequenzlänge: 5 - 40 Basen
- HPLC Reinigung inklusive
- Produktionszeit: 3 - 5 Werktage
- Lieferformat: trocken oder flüssig in gewählter Konzentration
- QC Report inkl. MALDI-TOF MS Spektren Online verfügbar
Farbstoff-Quencher Kombination:
| 5' Reporter |
ABS [nm] |
Em [nm] |
3' Quencher |
Price-Cat. |
| FAM [FAM] |
495 |
520 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
1 |
| Yakima Yellow [YAKYE] |
530 |
549 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
2 |
| HEX [HEX] |
535 |
556 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
2 |
| TexasRed [TxRed] |
583 |
603 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
1 |
| Cyanine5 [CY5] |
647 |
673 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
2 |
| ATTO 647N [ATTO647N] * |
646 |
664 |
MGB-Eclipse [MGBEQ] |
2 |
12MG
Vorteile des MGB-Moleküls in der Real-Time PCR
Sonden, die ein MGB-Molekül enthalten, bilden eine besonders stabile Verbindung, wodurch sich die Schmelztemperatur (Tm) signifikant erhöht. Somit ist es möglich kürzere Sonden in der Real-Time PCR zu verwenden (bis zu 13 Basen) als mit herkömmlichen TaqMan Sonden.
MGB Probes für Genexpressionsanalysen & SNP Genotypisierung
Die Doppelstang-DNA wird denaturiert indem die Temperatur erhöht wird. Zu diesem Zeitpunkt ist der Farbstoff der Sonde von dem MGB-Eclipse Quencher abgedunkelt.
Indem die Temperatur verringert wird, annealen die PCR Primer und die MGB-Sonde an ihre spezifische Zielsequenz. Eine allelische Diskriminierung wird durch ein gezieltes Annealing der MGB-Sonde erreicht (SNP Genotypisierung - Abbildung 2).
Die Taq Polymerase synthetisiert einen komplementäre DNA-Strang, indem sie die PCR Primer als Leitfaden nutzt. Sobald die Polymerase die MGB-Sonde erreicht, spaltet ihre 5' Nuklease Aktivität die Sonde und trennt den Farbstoff vom Quencher.
