SARS-CoV-2 Total RNA Sequencing
Ein optimierter RNA-Sequenzierungsprozess stellt eine hohe Genom-Abdeckung des SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) für jede Anwendung sicher, die eine Analyse des Volllängen-Genoms des Virus benötigt.
Dieser Service ist schon für Proben mit nur 100 ng Gesamt-RNA / Probe erhältlich.
Anwendungen
- Sequenzier-Service um die Epidemiologie von Infektionskrankheiten zu untersuchen
- Phylogenetische Studien
- Virus-Varianten Identifikation und eine Nachverfolgung der Antigen-Evolutions für die Impfstoffherstellung
- Corona Forschungsprojekte
Besonderheiten des SARS-CoV2 Total RNA Produkts
- Sequenzierung des gesamten viralen ssRNA Genoms
- 5 Million Read Paare garantiert
Projektspezifikationen
- Individuelle Chargengröße ab einer Probe
- Ribosomale Depletion jeder Probe
- Etablierte Protokolle für die Erstellung strangspezifischer Bibliotheken
- Flexible Sequenzierung beginnend mit 5 Mio. garantierten Read Pairs
- Mapping auf die SARS-CoV-2 Referenz; SNP Tabelle, Alignment-basierte Konsensus-Virusgenom-Sequenz Herstellung für alle Proben mit einer Genomabdeckung von > 90%
- Verfügbar mit ISO 17025 Akkreditierung
Produktdetails
Akzeptiertes Ausgangsmaterial für
- Gesamt-RNA aus verschiedenen Startmaterialien
- DNAse-freie RNA
Specifications
- Ribosomal Depletion
- Strang-spezifische cDNA Bibliothek
- 150 bp Paired End Reads
- Ein Vielfaches von 5 M Read Paaren garantiert
- Sequenzbereinigung um die Adaptoren und Basen mit schlechter Qualität zu entfernen
- Mapping von hochwertigen Sequenzierrads to der Referenz des SARS-CoV-2 Genoms
- Identifizierung der SARS-CoV-2 positiven Proben basierend auf der Genomabdeckungs-Analyse
- Bestimmung der Konsenussequenz* von SARS-CoV-2 der Isolate
- Ausführliche Berichte
*Die Konsensussequenz wird für alle Isolate erstellt die eine gute Abdeckung zur Referenzsequenz aufweisen (>3 Sequenzierreads decken >90% des SARS-CoV-2 Genoms ab)
- Rohdaten der Sequenzierung (FastQ)
- Konsensussequenz des SARS-CoV-2 Genoms der Isolate (Fasta)
- Analysereport (HTML|PDF)
- bis zu 24 Proben = 18 Werktage
- 25-50 Proben = 21 Werktage
- 51-100 Proben = 24 Werktage
Express Lieferzeit:
- bis zu 24 Proben = 13 Werktage
- 25-50 Proben = 16 Werktage
>> keine zusätzliche Lieferzeit für zusätzliche Datenpakete