Genbibliotheken

GeneStrands Genbibliotheken

Lineare Genbibliotheken sind PCR Produkte, die an bestimmten Positionen spezifische Mutationen enthalten. Diese Degenerationen werden während der Oligosynthese eingefügt. 

Spezifikationen

• Standard-Sequenzen bis 1000 bp
  moderater GC Gehalt (35-75%), keine langen Repeats und Homopolymerabschnitte (> 18 bp) oder kritische Hairpin-Strukturen (> 25 bp)
  
• Ausbeute bis zu 500 ng
• Versand als lyophilisiertes PCR Produkt

Qualitätskontrolle

• Einzelstrang-Sequenzierung der Genbibliothek

Fügen Sie wobble Basen in GeneStrands ein - und erhalten sie eine lineare DNA Genbibliothek zum attraktiven Preis

Bei Eurofins Genomics zahlen Sie einen Fixpreis pro degeneriertem Abschnitt und nicht für jede einzelne Position. Aber beachten Sie, dass die Komplexität ihrer Genbibliothek und somit die Anzahl möglicher Varianten sehr schnell in astronomische Höhen gehen kann. Deshalb sollten Sie versuchen die Komplexität so klein wie möglich zu halten.

Bitte beachten Sie:

Es kann vorkommen, das nach der Klonierung manche Klone noch weitere Mutationen in der Gensequenz enthalten. Das liegt an dem Gensyntheseprozess selbst: wir verwenden Oligonukleotide von bester Qualität für diesen Prozess, aber selbst hier können Mutationen auftreten (ungefähr 1 in 2000 bp). 

Falls es für Ihr Projekt unabdingbar ist, dass sie 100% richtige Sequenzen haben, kontaktierne Sie uns bitte. Wir können dann eine maßgeschneiderte Lösung für Ihr Projekt definieren.

Gebrauchsfertig

Nach der Klonierung einer linearen Genbibliothek in einen Vektor spricht man von einer klonierten Genbibliothek.

Die Klonierung Ihrer Genbibliothek kann entweder in unseren Standardvektor pEX-A2 (map) oder in einen Vektor Ihrer Wahl erfolgen. Üblicherweise erhalten Sie eine Genbibliothek mit einer Komplexität von bis zu 10⁸.

Spezifikationen

• Standard-Sequenzen bis 1000 bp
  moderater GC Gehalt (35-75%), keine langen Repeats und Homopolymerabschnitte (> 18 bp) oder kritische Hairpin-Strukturen (> 25 bp)
• Bis zu 10⁸ Varianten pro Genbibliothek
• Ausbeute bis zu 500 µg
• Versand der gesamten Genbibliothek in einem tube

Qualitätskontrollen

• Doppelstrang-Sequenzierung der klonierten Genbibliothek
• Einzelstrang-Sequenzierung von 10 Klonen

QC Kriterien

100% Sequenzhomologie der klonierten Genbibliothek zur erwarteten Sequenz, Mischpeaks an den degenerierten Positionen. Bitte beachten Sie, dass für manche Genbibliotheken das Hintergrundrauschen bei der Sequenzierung durch die degenerierten Positionen höher als "normal" ist.

Zusätzliche Optionen

• Sequenzierung von 96 individuellen Plasmiden
• Statistische Datenanalyse (Chi² Wert) von 96 Klonen, siehe Graphik oben rechts
• Glycerol-Kultur der klonierten Genbibliothek

Wichtige Informationen

Es kann vorkommen, das nach der Klonierung manche Klone noch weitere Mutationen in der Gensequenz enthalten. Das liegt an dem Gensyntheseprozess selbst: wir verwenden Oligonukleotide von bester Qualität für diesen Prozess, aber selbst hier können Mutationen auftreten (ungefähr 1 in 2000 bp). 

Falls es für Ihr Projekt unabdingbar ist, dass sie 100% richtige Sequenzen haben, kontaktierne Sie uns bitte. Wir können dann eine maßgeschneiderte Lösung für Ihr Projekt definieren.

Tipp

Durch das Hinzufügen einer Promotors und eines Terminators in die Sequenz der Genbibliothek, machen Sie aus jedem beliebigen Vektor einen Expressionsvektor, der sofort für das Hochdurchsatz-Screening eingesetzt werden kann.

Und es gibt noch mehr...

Zusätzlich zu den Combinatorial Libraries bieten wir folgende Genbibliotheken an:

• (Ala) Scanning Libraries
  Identifizieren sie Positionen von essentielle Aminosäuren innerhalb einer kodierenden Sequenz (ORF)

• Site Saturation (Mutagenesis) Libraries
  Testen Sie alle möglichen Aminosäuren an einer Position (Triplet / Codon)

• Truncation Libraries
  Gekürzte Versionen Ihres Gens

Für weitere Informationen und einem Angebot für Ihr Projekt kontaktieren Sie uns bitte.