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NGSelect Ready-to-Load

 

 

Bequeme Illumina-Sequenzierung von Ready-to-Load-Bibliotheken


Das Ziel unseres Produkts NGSELECT – RTL ist eine maximal schnelle, kosteneffiziente und benutzerfreundliche Lösung für Kunden mit Ready-to-Load-Bibliotheken (RTLs). Wissenschaftler können ihre einsatzbereiten Bibliotheken vorlegen und erhalten ihre Ergebnisse innerhalb weniger Werktage. Durch Multiplexing und Pooling der Proben wird die Effizienz und Wirtschaftlichkeit eines Illumina-Sequenzierlaufs signifikant erhöht.

 

 
 

Anwendungen

 

Sequenzierbereite Bibliotheken bieten klare Vorteile für Forscher, die häufig Next Generation Sequenzierungen mit Illumina durchführen

  • Höhere Erschwinglichkeit – Kosteneffektivität für NGS-Intensivbenutzer, insbesondere dank der Multiplexing-Optionen
  • Schnellere Ergebnisse – deutliche Verbesserung der Datenlieferzeiten
  • Verminderte Variabilität – durch semi-automatisierte Prozesse und optimierte Nutzung von Illumina-Durchflusszellen

 

Besonderheiten

 

  • Breites Spektrum an Sequenzierungsoptionen: Auswahl aus verschiedenen Reads-Modi, Read-Anzahlen und Lieferzeiten.
  • Umfassendes Know-how im Umgang mit Proben: semi-automatisierte Prozesse und optimierte Nutzung von Illumina-Durchflusszellen
  • Sequenzierungsabläufe mit ISO 17025-Akkreditierung
  • Sortieren nach Illumina Index Reads ohne zusätzliche Kosten
  • Präzise Bestimmung der Konzentration der Bibliothek sowie der geeigneten Verdünnung für die Sequenzierung

 

 

 

 

 

Produktspezifikationen & Bestellung

 

 

Akzeptiertes Ausgangsmaterial

  • Probentyp: Gereinigter Bibliothekspool, kompatibel mit Illumina-Sequenzierung und Index-Primer*
  • Volumen: mindestens 40 µL**
  • Konzentration: > 2,5 nM
  • Gesamtlänge der Bibliothek sollte zum gewünschten Lesemodus passen (Insertgröße + Sequenzieradapter):
    • 250 bp bis 450 bp für NovaSeq + PE150 Lesemodus
    • 250 bp bis 600 bp für MiSeq + PE300 Lesemodus
    • Minimale durchschnittliche Größe: 150 bp
    • Maximale durchschnittliche Größe: 800 bp (MiSeq), 650 bp (NovaSeq)
    • Für individuelle Optionen kontaktieren Sie uns bitte.
  • Puffer: RNase-, DNase- und proteasefreier Tris-HCl-Puffer (pH 7,5 – 8,0), EB oder Low TE (<0,1 mM EDTA)
  • Format: Barcode-beschriftete 1,5 ml Eppendorf Safe-Lock Tubes
  • Versandmethode: empfohlen auf Trockeneis

 

* Der einsatzbereite Bibliothekspool muss mittels Säulen oder Beads gereinigt werden, um niedermolekulare Verunreinigungen wie Primer, Nukleotide und Reaktionspuffer zu entfernen.

** Ein Röhrchen mit mindestens 40 µL pro Lane ist verpflichtend. Zum Beispiel werden für eine vollständige 10/25B Flow-Cell insgesamt 8 Röhrchen benötigt. Proben, die auf einer Lane sequenziert werden sollen, müssen vorab gepoolt werden.

Sequenzierungsplattformen

  • QC der Bibliotheksqualität und -quantität wird durchgeführt  

  • Technologie: Illumina Novaseq X+ oder MiSeq

 

Plattform Flow-Cell-Typ Lesemodus Lanes pro Flow-Cell Read-Paare pro Lane Read-Paare pro Flow-Cell Servicetyp*
NovaSeq X+  25 B PE150 8 3,25B 26B Standard
PE50/PE100 8 3,25B 26B Individuell
10B PE150 8 1,25B 10B Standard
PE50/PE100 8 1,25B 10B Individuell
1,5B PE50/PE100/PE150 2 800M 1,6B Individuell
MiSeq   PE250/PE300 1 k.A. 9,6–12,8M Standard
SE50/PE50/PE150 1 k.A. 9,6–12,7M Individuell

 

*Nur der Servicetyp "Standard" ist mit schnellen Bearbeitungszeiten kompatibel. Wenn ein "Individueller" Servicetyp benötigt wird, muss eine vollständige Flow-Cell bestellt werden. Bitte beachten Sie, dass dies eine längere Lieferzeit erfordern kann.

Asymmetrische Laufmodi können ebenfalls an Ihre spezifischen Anforderungen angepasst werden. Für Projekte, die eine andere Plattform oder Konfiguration erfordern, kontaktieren Sie uns gerne.

Zur Berechnung der finalen Datenmenge (Basen) multiplizieren Sie die Anzahl der Read-Paare mit der Leselänge und multiplizieren Sie das Ergebnis bei Paired-End (PE)-Sequenzierung mit 2.

Zum Beispiel ergibt eine Sequenzierung mit einem 150 bp Paired-End-Lesemodus auf einer Flow-Cell mit 10 Milliarden Reads etwa 3 Terabasen (Tb).

 

 

 

 

 

 

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