Short-Read Whole Genome Sequencing (WGS)

Präzises Whole-Genome-Sequencing mit Short-Read-Technologie

WGS Bakterien, Pilze, Hefe

WGS Human, Säuger, Pflanzen, Größere Eukaryoten

De novo-Assembly oder umfassende SNP-/Variantenanalyse?

Brauchen Sie etwas anderes?

NGS Prepaid Coupons

NGS Probenvorbereitung / Versand

Kostenlose Barcodes, UPS Label, Dropbox Verwendung

Wesentliche Vorteile unserer Whole‑Genome‑Sequencing‑Services

Qualität hat bei Eurofins höchsten Stellenwert

Produktspezifikationen

Zusätzliche Services & wichtige Links

Quick Start

Zuverlässigkeit

Genauigkeit

Flexibilität

Erfahrung

Sichere Daten

Frequently Asked Questions

Unsere Produkte und Dienstleistungen werden unter strengen Qualitätsmanagement- und Qualitätssicherungssystemen hergestellt und durchgeführt.

Zuverlässige genomische Einblicke durch Hochdurchsatzsequenzierung

Highlights für Short-Read-WGS

Anwendungen für Short-Read-WGS

Umfassender Workflow für die Genomsequenzierung

Bibliothekenherstellung

Sequenzierung

Sequenziertiefe

Coverage-Empfehlung

Coverage-Berechnung

ENTDECKEN SIE unsere flexiblen DNA-ANALYSE-LÖSUNGEN

De novo-Assembly

Variantenerkennung

Individuelle bioinformatische Analysen

Whole-Genome-Sequencing (WGS) mit der Illumina‑Short‑Read‑Technologie bietet hochpräzises Sequenzieren mit außergewöhnlicher Genauigkeit und ermöglicht die Detektion von Single-Nukleotid-Varianten (SNVs) und kleinen InDels.

Jetzt bestellen

Flexible Lösungen für alle Probentypen, einschließlich Menschen, Tiere, Pflanzen, Hefe, andere Eukaryoten, Bakterien oder Viren.
Kurze Durchlaufzeiten ab 12 Arbeitstagen
Unique Dual Indexing (UDI) gewährleistet hochwertige Daten
Skalierbare Datenausgabe, beginnend ab 5M Read-Paketen
Hochentwickelte Bioinformatik-Services & interaktive Analyseberichte
Optionaler DNA-Isolationsservice
Datenübertragung über sicheres FTP

De novo- und Resequenzierung kompletter Genome
Unser Standard-Variant-Analysis-Service umfasst die Detektion und Annotation von Keimbahn‑Single-Nukleotid-Polymorphismen (SNPs) sowie Insertionsen und Deletionen (InDels)
Zusätzlich bieten wir optionale Services wie die Analyse struktureller Varianten und die Detektion von Kopienzahlvariationen
Für größere strukturelle Varianten, Short Tandem Repeat (STR)-Expansionstypisierung, de novo-Assemblies und die Analyse modifizierter Basen besuchen Sie bitte unser Long-Read-WGS

Unsere Lösungen

HOW DOES IT WORK?

6 easy steps for a high quality WGS project

Studienplanung

Definieren Sie gemeinsam mit unseren Expert:innen die Probenanzahl, die gewünschte Datenmenge, das Ausgangsmaterial sowie die bioinformatischen Anforderungen, um Ihr Projekt mit dem optimalen Setup zu starten.

DNA Extraktion

Senden Sie uns Ihre Proben zur DNA‑Extraktion aus einer Vielzahl von Ausgangsmaterialien, darunter Bakterien, Zellen und Gewebe. Unsere langjährige Expertise gewährleistet zuverlässige Extraktionen in höchster Qualität.

Bibliothekenherstellung

Wir führen die Bibliothekenherstellung entsprechend den Anforderungen Ihres Projekts durch und verwenden dabei je nach Bedarf sowohl geringe als auch hohe Inputmengen, um optimale Ergebnisse zu erzielen.

Sequenzierung

Bestimmen Sie frei, wie viel Daten jede Probe erhalten soll, oder wählen Sie aus unseren vordefinierten Datenpaketen, die speziell für Whole‑Genome‑

Sequenzierungsprojekte entwickelt wurden.

Bioinformatische Analyse

Von de novo‑Assemblies bis hin zur präzisen Identifizierung von SNPs und Varianten bieten wir die bioinformatische Lösung, die am besten zu Ihren Forschungszielen passt

Zusätzliche Services

Optionale erweiterte Proben‑ oder Datenspeicherung sowie eine fachkundige Datenberatung stehen Ihnen zur Verfügung, um Ihr Projekt optimal zu ergänzen.

REQUEST A QUOTE

Wählen Sie WGS Bacteria, Yeast oder Fungi für eine garantierte Abdeckung in organismenspezifischen Tiefen, entscheiden Sie sich für WGS Flex, wenn eine abweichende Coverage benötigt wird, oder wählen Sie WGS Essential für Low‑Input‑Projekte, das nur minimale DNA-Mengen bei flexibler Datenmenge benötigt-

Jetzt bestellen

WGS Human bietet eine optimierte Dual‑Library‑Präparation mit Standard‑ oder Premium‑Serviceoptionen, während WGS Flex eine anpassbare Datenmenge für Säugetiere, Pflanzen und andere größere eukaryotische Genome – einschließlich des menschlichen Genoms – ermöglicht und damit die ideale Wahl ist, wenn maximale Flexibilität gefragt ist.

WGS Human

Zwei Bibliotheken pro Probe sorgen für geringe Duplikatsraten und eine gleichmäßige, GC‑bias‑freie Abdeckung.

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse.

Wählen Sie zwischen dem Premium (30x coverage garantiert) und Standard (ungefähr 30x) Service.

WGS Flex 2

Ideal für große Säuger und eukaryotische Genome, inklusive Pflanzen und Humanprojekte mit freier Datenmengen-Wahl.

Flexible Datenmenge auswählbar als Multiple von 5 M Read Paaren.

Zwei Bibliotheken pro Probe sorgen für geringe Duplikatsraten und eine gleichmäßige, GC‑bias‑freie Abdeckung.

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse.

Jetzt besellen oder ein Angebot anfordern

Die DNA-Menge wird vor der Bibliothekspräparation qualitätskontrolliert. Illumina-kompatible Bibliotheken werden mithilfe von Unique Dual Indexing für optimale Datenqualität erzeugt.

Die Sequenzierung erfolgt auf dem Illumina NovaSeq X+ System im 2 × 150 bp Run-Modus, um hochwertige Daten bei hohem Durchsatz zu gewährleisten.

Sie bestimmen die Sequenziertiefe, die am besten zu Ihrem Projekt passt.

Vordefinierte Pakete für Bakterien, Hefe, Pilze und menschliche Proben garantieren die empfohlenen Datenmenge für Ihr Projekt.
Mit WGS Flex können Sie das benötigte Datenvolumen frei wählen.

Falls Sie unsicher sind, welche Coverage Ihr Projekt benötigt, dienen Ihnen diese allgemeinen Richtlinien:

Keimbahn-/häufige Variantenanalyse: 20–50×
Somatische/seltene Varianten: 100–1000×
De novo-Assembly: 100–1000×

(Read-Länge) × (Gesamtzahl der Reads) ÷ (Genomgröße).

Die Sequenzierung eines 10 Mb Genoms mit 20 Millionen Reads bei 2 × 150 bp ergibt eine Coverage von etwa 600×.

Qualitätsbewertung der Sequenzdaten
De novo-Assembly der Reads
Annotation des Draft-Assemblies
Reporting & Beratung

Demo-Report „De novo Assembly“

Mapping gegen ein Referenzgenom
Detektion von SNPs und InDels
Annotation der detektierten SNPs und InDels (unter Verwendung von dbSNP)
Zuordnung der Effekte auf Proteinebene (mithilfe von Ensembl)

Mehr Details zur Variantenanalyse

Wir bieten optionale Services wie die Analyse struktureller Varianten, die Detektion von Kopienzahlvariationen (CNVs), Tumor-vs.-Normal- und Tumor-only-(somatische)-Variantenanalysen zur Identifizierung genetischer Mutationen in Tumorproben, Joint-Genotyping zur Analyse mehrerer Proben hinsichtlich gemeinsamer genetischer Varianten sowie Populationsgenotypisierung zur Untersuchung genetischer Vielfalt in bestimmten Gruppen.
Anpassbare Lösungen zur Modifikation von Bioinformatik-Pipelines und Tools entsprechend Ihren Forschungsanforderungen
Für größere strukturelle Varianten, STR-Expansionstypisierung (Short Tandem Repeat) und die Analyse modifizierter Basen besuchen Sie bitte unseren Long-Read Human WGS Service.

Kontaktieren Sie uns

NGS Prepaid Coupons erleichtern die Projektplanung, da sie den administrativen Aufwand reduzieren und eine frühzeitige Preisstabilität sicherstellen. Sie ermöglichen es Ihnen, mit der Sequenzierung zu beginnen, sobald Sie bereit sind – ohne auf neue Kaufgenehmigungen warten zu müssen.

Verfügbar ausschließlich für WGS Flex und WGS Bacteria / Yeast / Fungi.

Hier finden Sie alle wichtigen Informationen zur Vorbereitung und zum Versand Ihrer Proben, einschließlich Richtlinien zur Verpackung und Beschriftung.

Wenn Sie Material für die DNA‑Extraktion einsenden, enthält dieser Abschnitt zudem eine Übersicht über akzeptierte Probentypen und die erforderlichen Inputmengen.

Kostenlose Barcodes sind für die Probenverarbeitung verpflichtend, um eine korrekte Nachverfolgung und Handhabung Ihres Materials sicherzustellen.

Wir bieten außerdem kosteneffiziente Versandoptionen an, um das Einsenden Ihrer Proben so einfach und erschwinglich wie möglich zu machen.

Reichen Sie Projekte bereits ab einer einzigen Probe ein und geben Sie Ihre Bestellung ganz bequem online auf.

Zwei Bibliotheken für große Genome und eine kostenlose Wiederholpräparation (Premium) im Fehlerfall – für durchgängig höhere Datenqualität

Strenge Qualitätskontrollprozesse für jeden Run. ISO‑17025‑zertifiziertes Labor.

Wählen Sie ein vordefiniertes Produkt oder bestimmen Sie Ihre Datenmenge frei – beginnend ab 5 M Read‑Paaren.

Unsere jahrzehntelange Expertise im Bereich genomischer Services steht für konstant zuverlässige Leistung.

Ihre Daten werden über unsere verschlüsselte Online‑Plattform bereitgestellt.

Wir empfehlen die Aufreinigung mit kommerziell erhältlichen Kits - basieren auf DNA-bindenden Beads oder mit Säulen.

Sie können den Status Ihrer Bestellung in Ihrem Ecom Account nachverfolgen.

Bitte navigieren Sie zu ihrem "Account" -> “Bestellungen” -> “Meine Bestellungen”.

Hier sehen Sie alle Ihre Bestellungen aufgelistet.

Für detailliertere Informationen zu einer Bestellung klicken Sie bitte auf das "Statusverfolgungs"-Symbol (siehe unten). Es führt Sie zu unserer Status-Seite für diese spezielle Bestellung. Hier finden Sie dann alle Details zu jeder Probe.

Melden Sie sich mit Ihrer E-Mail-Adresse und Ihrem Passwort in Ihrem Eurofins-Konto an und klicken Sie auf „Meine Bestellungen“, dann auf das Symbol neben Ihrer Bestell-ID (siehe Screenshot unten).

Die Dateien finden Sie im Abschnitt „DOKUMENTE & DATEIEN HERUNTERLADEN“.

Falls Sie komprimierte Dateien erhalten haben, empfehlen wir **7-ZIP** (https://www.7-zip.org/), um diese zu entpacken. Dateien werden 8 Wochen nach der Bereitstellung von unserem Server gelöscht.

Alternativ können Sie auf Ihre Daten über unseren FTP-Server unter **ngs-ftp.eurofinsgenomics.eu** zugreifen, indem Sie den Benutzernamen (das „ftp-“ gehört zum Benutzernamen) und das Passwort verwenden, das Sie per E-Mail erhalten, sobald Ihre ersten Daten bereitgestellt werden. Falls Sie Ihr Passwort vergessen haben, geben Sie **ngs-ftp.eurofinsgenomics.eu** in Ihren Browser ein und wählen Sie die Option „Passwort vergessen?“.

Sollten Sie auf Probleme stoßen oder Fragen haben, zögern Sie bitte nicht, uns zu kontaktieren.

Für unsere Standard‑Services garantieren wir weder eine bestimmte Sequenziertiefe noch eine minimale Datenmenge. Diese Angebote sind als hochgradig optimierte Workflows konzipiert, ohne individuelle Projektbetreuung oder Zusicherung des Datenertrags.

Eine korrekt eingereichte, hochwertige Probe erreicht in der Regel die in der Produktbeschreibung angegebene Read‑Menge. Da Proben und biologisches Material jedoch variieren können, kann es gelegentlich zu unzureichender Coverage kommen.

Wenn Sie garantierte Datenmengen, eine dedizierte Projektbetreuung und iterative Anpassungen benötigen, um die angestrebte Coverage sicherzustellen, empfehlen wir unseren Premium Service>>, bei dem ein Projektmanager Ihr Projekt aktiv überwacht und die Lieferung des vereinbarten Datenvolumens sicherstellt.

Unsere Standardprodukte sind darauf ausgelegt, hochwertige Ergebnisse so schnell und kosteneffizient wie möglich zu liefern. Um dies zu erreichen, laufen diese Workflows in hochoptimierten, schlanken Prozessen, die keine individuelle Projektbetreuung oder iterativen Anpassungen ermöglichen, falls eine bestimmte Datenmenge nicht erreicht wird.

Für Projekte, die eine garantierte Datenmenge, dedizierte Betreuung und aktive Optimierung erfordern, bieten wir unseren Premium Service an. Hier überwacht ein spezialisierter Projektmanager Ihren gesamten Workflow und stellt sicher, dass das vereinbarte Datenvolumen zuverlässig erreicht wird.

Für eine garantierte Datenmenge bestellen Sie einfach über unsere Premium-Seite >> — dort können Sie flexibel Ihr gewünschtes Datenvolumen sowie das ideale Produkt für Ihr verfügbares Ausgangsmaterial für Bakterien, Hefe oder Pilze auswählen.

WGS Bakterien

Garantiert 100x Coverage (für Genome bis zu 9 Mb)

Sequenzierung mittels 2 x 150 bp Run Modus

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse

WGS Hefe

Garantiert 55x Coverage

Sequenzierung mittels 2 x 150 bp Run Modus

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse

WGS Pilze

Garantiert 50x Coverage

Sequenzierung mittels 2 x 150 bp Run Modus

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse

WGS Essential

Nur 100 ng genomische DNA werden benötigt.

Freie Wahl der Datenmenge als Multiple von 5 M Read Paaren.

WGS Flex
Freie Wahl der Datenmenge als Multiple von 5 M Read Paaren.

Optionale DNA Extraktion und Bioinformatische Analyse

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