Sanger Sequenzierung für jeden Bedarf                                            

Sequenzverifizierung gemäß ISO 17025 & GLP

 

 

Sanger-Sequenzierung für Sequenzverifizierung und Primer Walking

Zertifiziert nach ISO 17025 & GLP

 

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Je nach den Anforderungen Ihres Projekts bieten wir die folgenden Optionen zur Verifizierung der Identität Ihrer DNA-Probe an:


Sequenzverifizierung

Die Sequenzverifizierung ist ein Service, der darauf abzielt, die genaue Nukleotidsequenz eines bekannten DNA-Konstrukts zu bestätigen. Sie ist die ideale Lösung, wenn Sie die Identität und Integrität eines bereits amplifizierten oder synthetisierten DNA-Konstrukts (z. B. Plasmide, BACs, etc.) verifizieren müssen. Mit hochwertiger Sanger-Sequenzierung bestimmen wir die Nukleotidsequenz auf beiden Strängen und detektieren mögliche Varianten, wie Punktmutationen, Insertionen/Deletionen oder Rekombinationsevents.


Primer Walking

Primer Walking ermöglicht die de-novo-Sequenzierung von DNA-Konstrukten oder Amplikons, indem Primer basierend auf neu gewonnenen Sequenzinformationen sequenziell entworfen werden. Der Prozess beginnt mit einem ersten Primer (typischerweise auf bekannte Regionen wie PCR-Primer-Stellen oder Plasmid-Rückgrat-Elemente ausgerichtet). Sobald ein neuer Sequenzabschnitt erhalten wurde, wird ein weiterer Primer entworfen, um die Sequenz weiter auszudehnen. Dieser iterative Prozess wird fortgesetzt, bis die gesamte Zielregion vollständig sequenziert ist.


Ob Sie eine präzise Sequenzbestätigung benötigen oder eine komplexe DNA-Region analysieren möchten, empfehlen wir die bi-direktionale (2-fache) Sequenzierung. Dieser Ansatz verbessert die Variantenerkennung und ermöglicht eine zuverlässige Ansicht beider DNA-Stränge. Um die Ergebnisgenauigkeit weiter zu verbessern, sollte die Sequenzierung mindestens in zwei unabhängigen Reaktionen (4-fache Abdeckung) durchgeführt werden. Dies erhöht nicht nur das Vertrauen in die Daten, sondern ermöglicht auch die Identifikation von strand-spezifischen Merkmalen wie Nicks oder Haarnadelstrukturen. Falls Unklarheiten auftreten, werden zusätzliche Primer entworfen und angewendet, um diese zu klären.

 

Unser Service umfasst:

 

  • Qualitätskontrolle des eingehenden DNA-Materials
  • Design und Synthese spezifischer Primer
  • Bioinformatische Analyse unter Verwendung der entsprechenden Software:
    • Zusammenführung der Sequenzdaten zur Erzeugung einer Konsenssequenz
    • Qualitätsprüfung der Konsenssequenz inkl. Qualitätsbericht
  • Kostenlose Speicherung der Template-DNA und aller Primer für 3 Monate
  • Verifizierungsgenauigkeit von bis zu >99,99999 %

Ihre Vorteile auf einen Blick:

 

  • Individuelle Unterstützung durch unser Sanger-Sequenzierungsteam
  • Design und Synthese der benötigten Primer sind inklusive
  • Vielfältige bioinformatische Lösungen und Reporting-Optionen verfügbar (siehe unten)
  • Certificate of Analysis (CoA) für jede Probe
  • Umfassender Bericht (einschließlich einer Überprüfung) als Alternative zum CoA erhältlich
  • ISO 17025-zertifizierter Produktionsprozess
  • Service vollständig in Übereinstimmung mit GLP verfügbar
  • Kunden-Audits können auf Anfrage organisiert werden

 

 

 

 

 

 

 Weiterführende Information

 

 

Datenformat & Lieferung


Sie erhalten die folgenden Originaldaten in Ihrem Online-Account:

  • *.ab1: Elektropherogramme im AB1-Format
  • *.cons: Konsenssequenz im FASTA-Format (MS-DOS TXT)
  • *.qual: Qualitätsbericht für jede Konsenssequenz (MS-DOS TXT)
  • *.align: Alignment der einzelnen Reads zur Erstellung eines Konsenses (MS-DOS TXT)
  • *.comp: Alignment-Vergleich mit einer Referenzsequenz (MS-DOS TXT)

 

Lieferzeiten:

  • Sequenzverifizierung: 10 Arbeitstage / 10 kb
  • Primer Walking: 8 Arbeitstage / 2 kb

 

 

 

Sanger-Sequenzierung gemäß GLP

Sanger Sequencing in Compliance with Good Laboratory Practice (GLP)


In addition to the services described above, the following components are included when sequencing is performed under GLP:

  • Preparation of Study Plan incl. description of materials and methods (incl. one revision after sponsor´s review)
  • Evaluation and documentation of sequencing results.
  • Provision of an overview table (embedded in the Study Report, if feasible) where possible sequence variations are listed
  • Preparation of Study Report incl. GLP compliance statement (incl. one revision after sponsor´s review)
  • Study Inspection by QA and Quality Assurance Statement
  • Archiving the study data / documentation for 15 years


To ensure the quality of our GLP sequencing service, we are routinely assessed by first and second external auditors. Additionally, we perform regularly facility and process audits.

 

 

Referenzen:


Die Sequenzierung erfolgt nach den Standardmethoden und in Übereinstimmung mit

CLSI-Richtlinie MM09-A; Vol. 34 No. 4, 2014; Nucleic Acid Sequencing Methods in Diagnostic Laboratory Medicine, Approved Guideline - Second Edition


Die Durchführung von Sequenzierungsstudien erfolgt gemäß

OECD-Richtlinie ENV/MC/CHEM(98)17 (rev.1999): Die Grundsätze der Guten Laborpraxis (Monografie Nr. 01) und OECD-Richtlinie ENV/JM/MONO(1999)23 (rev. 2002): Kurzzeitstudien und GLP (Monografie Nr. 07)


Qualitätssicherungsmaßnahmen (QA) im Zusammenhang mit Sequenzierungsstudien (Überprüfung des Studienplans, Inspektion der Studie, Studienbericht und Rohdaten) werden durchgeführt gemäß

OECD-Richtlinie ENV/JM/MONO (1999) 20 (03-Oktober-2002): Qualitätssicherung und GLP

 

 

 

 

Individuelle Projekte 

 

 

Individuelle Projekte sind ebenfalls möglich, um weitere spezifische Anforderungen gemäß ISO 17025 zu erfüllen. Zusätzliche Dienstleistungen können abteilungsübergreifend angeboten werden, z. B. mit vorgelagerter Extraktion einschließlich Pre-PCR. Bitte fragen Sie uns nach einem individuellen Service, und wir prüfen, inwieweit dieser umgesetzt werden kann.

 

Fordern Sie ein Angebot für Ihr individuelles Projekt an

 

 

 

 Literatur

 

 

Quality is important for us at Eurofins

Our products and services are produced and performed under strict quality management and quality assurance systems.

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