Sie können 12 bp UDI-Sequenzen auf MiSeq-Systemen verwenden, aber aufgrund der Einschränkungen der MiSeq-Kit-Chemie sind die folgenden Anpassungen erforderlich:

• Lesen Sie beide Indexsequenzen in voller Länge von 12 bp, verkürzen Sie jedoch die Länge von Read 1 und Read 2 um zwei Basen, was zu einem 2x299 bp-Read für das 300-Zyklen-Kit führt.
• Alternativ können Sie die Indexsequenzen mit jeweils 10 bp lesen. Für einige unserer UDIs kann dies jedoch zu einem Edit-Abstand von 2 führen. Stellen Sie in solchen Fällen sicher, dass die Demultiplexierung nur mit perfekten Index-Übereinstimmungen durchgeführt wird (Fehlertoleranz = 0).