Die Abdeckung wird mit folgender Formel berechnet:  

(Read-Länge) × (Gesamtanzahl der Reads) ÷ (Genom-Größe). 

Zum Beispiel: für die Sequenzierung eines 10Mb großen Genoms mit 20 M Reads bei einem Read-Modus von 2 x 150 bp beträgt die Abdeckung 60x.