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Neue Formel zur Berechnung der Oligokonzentration

Eurofins hat die Formel zur Bestimmung der Oligo-Konzentration aktualisiert, um Sie mit genaueren Werten für Ihre Anwendungen zu unterstützen.

Einführung

Die Beziehung zwischen der Substanzmenge eines Oligos, gemessen in OD260 und dem molaren Extinktionskoeffizienten bei 260 nm (ε260) wird wie folgt berechnet:
nmol = OD260 x 106 / ε260
Der molare Extinktionskoeffizient ist eine einzigartige physikalische Eigenschaft jedes Oligonukleotids, die durch die Nukleotidzusammensetzung bestimmt wird.

Der ε260 eines Oligonukleotids berechnet sich aus der Summe aller ε260-Werte der Nukleotide in dieser Oligosequenz.


Was ist neu

Die ursprüngliche Formel, die Eurofins zur Berechnung der Substanzmenge verwendet, lautete:
nmol = OD x 100 / (1.54 x nA + 0.75 x nC + 1.17 x nG + 0.92 x nT)
(n = Anzahl entsprechender Basen)

Jetzt hat Eurofins auch eine neue Formel für die Berechnung des Molaren Extinktionskoeffizient implementiert, die die Bestimmung der Substanzmenge genauer berechnet. Die neue Formel basiert auf der Nearest-Neighbor-Methode die sequenzspezifischen Effekte berücksichtigt:

nmol = OD x 106 / e260  

Für Ihre Oligos können Sie in Ihren Einstellungen festlegen, welche Formel zur Berechnung der Oligokonzentration angewendet werden soll.


Die Nearest-Neighbor Formel

Sowohl der Extinktionskoeffizienten des nächsten Nukleotids sowie der Extinktionskoeffizienten der einzelnen Basen werden in der "Nearest-Neighbor" Formel für die Berechnung des Gesamt-Extinktionskoeffizient eines Oligonukleotids verwendet.

 

Neue Standardprimer für alle Sanger-Sequenzier-Services

Einführung

Seit dem Zusammenschluss von GATC und Eurofins Genomics haben wir separate Listen mit kostenlosen Standardprimern für die Sanger-Sequenzierung von GATC und Eurofins angeboten. 

Ehemalige Standard Primer GATC & Standard Primer Eurofins


Was sich ändert

Die am häufigsten verwendeten und gebräuchlichsten Standardprimer von Eurofins und GATC sind jetzt vereint.

Diese neu definierten 80 Standardprimer sind ab sofort für alle Sanger-Sequenzier-Services kostenlos erhältlich: Neue Standard Primer

Die meisten Primer sind unverändert. Einige von ihnen wurden ersetzt, leicht umbenannt oder die Sequenz hat sich leicht geändert. Details der Änderungen.

Einige der früheren Standardprimer wurden wegen unzureichender Nachfrage aus dem Programm genommen. Liste der nicht mehr verfügbaren Primer


Wichtig für Ihre Bestellung

Bitte verwenden Sie unsere neuen Excel-Vorlagen zum Hochladen Ihrer Sequenzierreaktionen. Diese können auf der jeweiligen Bestellseite heruntergeladen werden.

 

 

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