INVIEW Liquid Biopsy Oncoexome

Umfassendes Profil aller vorhandenen Mutationen im Exom

INVIEW Liquid Biopsy Oncoexome ist der erste nicht-invasive Service, der Forschern und Klinikern einen Überblick über alle protein-kodierenden Regionen im Genom eines vermuteten Krebspatienten bietet.

Das Krebs-Exom-Sequenzierungstool bietet die Möglichkeit, neue Varianten, wiederkehrende oder häufige somatische Mutationen in zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) zu entdecken, in Fällen, in denen begrenzte Informationen zur genomischen Instabilität assoziiert mit dem Tumor vorliegen.

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Industrie-optimiert

Anwendungen

Exomanalyse des Tumorexoms aus Plasma ctDNA mittels eines nicht-invasiven Bluttests, wenn eine Gewebebiopsie nicht möglich oder empfohlen wird.
Untersuchung aller Mutationen in den kodierenden Regionen eines vermuteten Krebspatienten.
Krebsprofilierung in Fällen, in denen nur begrenzte Informationen zu tumorassoziierten Mutationen vorliegen.
Entdeckung struktureller Varianten, neuer und häufiger genomischer Veränderungen.
Vergleich von Exomen aus Gewebebiopsie- und Liquid-Biopsieproben.
Auswahl von Mutationen für weitere Analysen.

Besonderheiten

Analyse neuer und bekannter Tumormutationen in ctDNA basierend auf Next-Generation Sequencing (NGS).
Optimierte Protokolle für die Extraktion von geringen Mengen ctDNA aus Plasma.
Eigene Arbeitsabläufe zur Erstellung von Bibliotheken mit hoher Komplexität.

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Produktspezifikationen & Bestellung

Produktdetails

Das Full-Service-Paket, das von INVIEW Liquid Biopsy Oncoexome angeboten wird, umfasst folgende Leistungen:

Krebs-Exom-Sequenzierung von zirkulierender TumordNA (ctDNA)
Optimierte Protokolle für die Bibliotheksvorbereitung mit niedrigen Duplikatraten
Mutationserkennung mit einer Sensitivität von bis zu 5 %, abhängig von den Genloci
Der gesamte Prozess wird gemäß ISO 17025 durchgeführt

Akzeptiertes Ausgangsmaterial

Akzeptiertes Ausgangsmaterial:

4 mL Plasma-Probe
15 ng bereits isolierte zellfreie DNA (bis zu 30 µl / Konzentration > 0,5 ng/µl)

Sequenziertechnologie

Illumina 150 bp paired-end Sequenzierung

Bioinformatische Analyse

Schnellere Identifizierung relevanter genetischer Veränderungen basierend auf kontrollierten biologischen Inhalten aus der QCI Interpret Translational Knowledge Base
Priorisierung der erfolgversprechendsten Varianten zur weiteren Analyse

Lieferumfang

Alignment-Datei (bam)
SNP- und InDel-Tabellen einschließlich annotierter Varianten und Auswirkungen (VCF, TSV, BED)
Umfassender Datenanalysebericht (PDF)

Zusätzliche Informationen

Zusätzliche Informationen:

Unsere Rundum-Diagnoselösung für die Sequenzierung des Tumorexoms von ctDNA, isoliert aus Liquid-Biopsien, bietet Ärzten und Forschern eine strenge Qualitätskontrolle während des gesamten Prozesses. Das Produkt umfasst eine Reihe von Vor-Sequenzierungs-Services, beginnend mit der Isolierung von ctDNA aus Proben mit geringem Input, bis hin zur Bibliotheksvorbereitung mit reduzierten Duplikatraten sowie einer hervorragenden Exon-Anreicherung und gleichmäßiger Abdeckung mit der neuesten Chemie von Agilent's SureSelect.

Weiterführende Links

Complete portfolio overview for Oncology

Blog article: Human exome sequencing with lower coverage and better costs

Blog article: How to handle clinical samples for successful exome sequencing