Was Sie von unseren NGSgrade Oligos 2.0 erwarten können
- Typische Kreuzkontaminationsrate von 0,01 % bis 0,05 %, bestätigt durch unser NGS-Labor (siehe Kreuzkontaminationsrate)
- Verfügbare Mindestmengen von 4 nmol, 10 nmol und 25 nmol
- DNA-Sequenzlänge von 15–120 Basen
- Verfügbare Modifikationen sind PTO-Bindungen, 2’-Desoxyinosin, 2’-Desoxyuridin und 5’-Phosphat
- Die Qualität wird durch OD-Messung und ESI-MS (Elektrospray-Ionisations-Massenspektrometrie) sichergestellt.
- Ein Online-Qualitätsbericht, einschließlich der ESI-MS-Spektren, kann bestellt werden
- Auswählbare Lösungsmittel sind bidestilliertes Wasser, TE-Puffer (10 mM Tris, 1 mM EDTA; pH = 8) oder Low EDTA Puffer (10 mM Tris, 0,1 mM EDTA, pH = 8)
- Schnelle Lieferzeiten ab 8 Arbeitstagen
Zur Lieferung in Tubes:
- Oligos werden in 2ml Tubes mit Schraubverschluss entweder lyophilisiert oder in flüssiger Form in der ausgewählten Konzentration geliefert
Zur Lieferung in Platten:
- Oligos werden in der ausgewählten 96-Well-Platte in flüssiger Form in der definierten Konzentration geliefert
- Es sind mindestens 12 Oligos pro 96-Well-Platte erforderlich
Die Kreuzkontaminationsrate von 0,01 bis 0,05 % wurde durch Sequenzierung repräsentativer Sets von Unique Dual Index (UDI)-Primer-Paaren unter Verwendung von Illumina-Instrumenten in der europäischen NGS-Sequenzierungsanlage von Eurofins Genomics bestimmt. Die angegebene Rate stellt den typischen Gesamtprozentsatz der Lese-Paare dar, die nicht den erwarteten UDI-Kombinationen für einen Satz von 96 UDI-Primer-Paaren entsprechen. Die entsprechende Anwendungsnotiz zeigt eine Kreuzkontaminationsrate von 0,0014 % für einen Satz von 14 UDI-Primer-Paaren.
Bitte beachten Sie, dass die Gesamtkreuzkontaminationsrate (Prozentsatz der falsch zugeordneten Lese-Paare) von der Gesamtanzahl der analysierten UDI-Primer-Paare parallel beeinflusst wird. Je mehr UDI-Primer analysiert werden, desto höher kann die Gesamtkreuzkontamination sein, da mehr unerwartete Indexkombinationen zugeordnet werden können.
In allen Fällen wäre die tatsächliche Kreuzkontamination der Primer sogar noch geringer, wie oben angegeben. Dies liegt daran, dass die Zuordnung von Lesevorgängen zu anderen unerwarteten UDI-Primer-Paaren eine Folge von Primer-Kreuzkontamination und Index-Hopping während der Sequenzierung ist. Eine Unterscheidung zwischen diesen Ursachen ist in diesem Analyse-Setup nicht möglich.
Bitte beachten Sie, dass Eurofins Genomics die Kreuzkontaminationsrate für jeden einzelnen Satz von produzierten und versandten NGS-Oligonukleotiden nicht bestimmt.
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Gesamte Kreuzkontaminationsrate
pro UDI-Satz (% Gesamtlesepaare, die nicht den erwarteten UDI-Kombinationen entsprechen) |
Die niedrigste gemessene Kreuzkontamination pro UDI-Kombination |
Referenz |
| Eurofins Genomics NGSgrade Oligos 2.0 |
Typisch 0.01 - 0.05% |
0.00446% |
Set of 96 UDI Primer-Paaren |
| Eurofins Genomics NGSgrade Oligos 2.0 |
0.0014%
(siehe Application Note) |
0.00045% |
Set of 14 UDI Primer-Paaren |
| Mitbewerber |
0.0208%
(siehe Application Note) |
0.00767% |
Set of 14 UDI Primer-Paaren |
Produktdaten
Eurofins Genomics verwendet ein neues und proprietäres Synthesegerät zur Herstellung der hochqualitativen NGSgrade 2.0 Oligonukleotide. Dieses Gerät ermöglicht eine unvergleichliche Kopplungseffizienz, und damit zu einem sehr hohen Prozentsatz an Vollängen-Oligonukleotiden.
Was Sie von unseren NGSgrade Oligos erwarten können
Optimierte und verifizierte Produktspezifikationen:
- Garantierte Reinheit von >80% durch HPLC Reinigung
- Spezielle kreuzkontaminationsfreie Prozessabläufe nach Synthese
- Strenge Qualitätskriterien, überprüft durch MALDI-TOF MS
- Synthesemaßstäbe von 0.01 bis 1.0 µmol
- Wählbares Lieferformat: Lyophilisiert oder konzentrationseingestellt
Minimum Ausbeuten (OD) pro Scale:
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Synthesis scale
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0.01 µmol
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0.05 µmol
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0.2 µmol
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1.0 µmol
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HPLC
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Min. Ausbeute [OD] |
1 |
2 |
4 |
10 |
Zusätzliche kostenlose Online Funktionen
- Fügen Sie eine persönliche Note zu ihrer Oligo resp. Platte
- Berechnen Sie die Komplementärfolge
- Auswahl unterschiedlicher Tube-Etiketten
- Verfolgen Sie ihren Produktions- und Lieferstatus Online
- Sehen Sie sich Ihren Bestellvorlauf unter "Meine Bestellungen" an
Oligos für Amplikon Sequenzierung auf dem NovaSeq
Hochqualitative NGS Adapter Oligos für verbessertes Multiplexing via Sample-Tagging.
Eurofins Genomics' NGS Experten haben individuelle Barcode-Sequenzen (=Tags) designed, die an Ihre spezifische Primer-Sequenz angehängt werden. Die daraus resultierende Gesamtsequenz der Primer ermöglichen eine optimierte Sequenzierung von Proben-Pools, unabhängig von der Anzahl an Proben.
Die Tags wurden so entworfen, dass bis zu 4 Sequenzierfehler im Tag Bereich passieren können, ohne dass Reads einer falschen Probe zugeordnet werden. Mis-Assignements sind damit praktisch ausgeschlossen. Die individuellen Tags bestehen aus 10 Nukleotiden, die an den Forward Primer angefügt werden.
Die designten Primer können mit unserem NGSelect Amplicon Adaptor Ligation Service oder mit Ihrem eigenen Sequenzierprotokoll verwendet werden.
Oligos für NGS Amplikon Sequenzierung auf dem MiSeq
Hochqualitative PCR Primer für verbessertes Multiplexing via Sample-Tagging.
Wenn Sie auf dem MiSeq sequenzierunge möchten, dann benötigen Sie für die PCR Primer mit universellen Adaptorsequenzen.
Eurofins Genomics fügt diese Adaptorsequenzen automatisch an die targetspezifischen Sequenzen an. Dadurch wird bei Ihrer Bestellung sichergestellt, dass Sie mit korrekten, validierten und optimierten Primersequenzen arbeiten.
Die designten Primer können mit unserem NGSelect Amplicon 2nd PCR Service verwendet werden