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TubeSeq Supreme

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Sanger-Sequenzierung von Plasmiden und PCR Produkten in Tubes mit

TubeSeq Supreme

 

 

TUBESEQ SupremE

Prepaid Barcodes

Primer Barcodes

Sample Barcodes

 

Highlights von TubeSeq Supreme:

 

  • Alle Arten von Probenmaterial, inkl. großer Konstrukte sind möglich
  • PCR Aufreinigung ist als zusätzliche Dienstleistungen verfügbar
  • Erweiterte Optionen für komplexe Sequenzregionen (Erweitertes Cycle Sequencing, Spezialchemie) können pro Reaktion ausgewählt werden
  • Bis zu 8 Reaktionen können pro Probe bestellt oder aus der gelagerten Probe nachbestellt werden
  • Flexible Zahlungsmöglichkeiten mit Prepaid Barcodes und Coupons oder auf Rechnung
  • Datenlieferung am nächsten Werktag bis 18:00 Uhr

Ihre Vorteile auf einen Blick:

 

  • Sie erhalten Leseweiten von bis zu 1.100 Basen
  • Q20-, Q30- oder Q40 Daten sind kostenfrei auswählbar
  • Wiederholung aufgrund technischer Ursachen* inklusive
  • Kostenlose Aufbewahrung von Template-DNA, synthetisierten und beigefügten Primern – siehe „Aufbewahrung von Material- und Daten“
  • Längere Aufbewahrung von synthetisierten und beigefügten Primern auf Anfrage möglich
  • Einfache Nachbestellung neuer Reaktionen aus gelagerten Proben

 

* Als technisches Versagen wird ein chemischer oder technischer (EDV, Maschinen) Defekt in unserem Labor definiert. Um sicherzustellen, dass die Sequenzierqualität nicht durch einen technischen Ausfall beeinträchtigt wird, wird bei jedem Sequenzierlauf eine interne Qualitätskontrolle durchgeführt. Darüber hinaus analysiert eine ausgeklügelte Software jede Platte unter Berücksichtigung von Parametern wie Qualitätswerten (QV) und Leselängen.

Wenn Sie als Ergebnis Ihrer Sequenzierungsreaktion "DONE_QV_NOT_MET" sehen, bedeutet dies, dass die interne Qualitätskontrolle bestanden wurde, aber einige Probenqualitätswerte nicht erreicht wurden. (z. B. Proben- oder Primerkonzentration oder -volumen, Sequenzdesign oder -struktur usw.)

 

 

 

>> kostenlosen test anfordern

>> FAQ's Sanger Sequenzierung

>> Tube Barcode Labels

>> Primer Barcodes

 

 

Weiterführende Informationen

 

 

Probenvorbereitung & Versand TubeSeq Supreme


Bitte liefern Sie uns folgende Konzentrationen und Volumina:

Probenart
Produktlänge
Konzentration
Vol. 1-8 Rkt.
Plasmid DNA < 30 kbp 50-100 ng/µl 20 µl
BAC/PAC/Cosmid DNA 30 - 200 kbp 200-1000 ng/µl 20 µl
Gereingte PCR Produkte 150-300 bp 1 ng/µl 20 µl
  300-1000 bp 5 ng/µl 20 µl
  1000-3000 bp 10 ng/µl 20 µl
Ungereinigte PCR Produkte 150-300 bp 4 ng/µl 20 µl
  300-1000 bp 10 ng/µl 20 µl
  1000-3000 bp 20 ng/µl 20 µl
Beigefügte Primer 16-25 Basen 10 pmol/µl 20 µl*

* Der Primer muss ein Gesamtvolumen von 20 µl haben (doppelt destilliertes Wasser oder 5 mM Tris-HCl); Für jede weitere Sequenzierungsreaktion werden 2 µl Primervolumen benötigt

Quantifizieren Sie die Template-Konzentration mittels Agarosegel oder Photometer zur Sicherstellung präziser Ergebnisse.

 


Premixed Proben (Mischung aus DNA und Primer):

  • Templates sollten aus 15 µl aufgereinigter DNA in einer der in der obigen Tabelle angegebenen Konzentrationen bestehen
  • Fügen Sie 2 µl Primer mit einer Konzentration von10 pmol/µl (10 µM) hinzu
  • Das Gesamtvolumen Ihrer voreingestellten Probe muss 17 µlbetragen

 

 
Bitte senden Sie uns Ihre Proben ausschließlich wie unten beschrieben zu:

  • Verwenden Sie 1,5ml „Safe Lock“-Tubes für Ihre Templates und Primer
  • Verkleben oder umwickeln Sie Ihre Tubes nicht mit Parafilm. „Safe Lock“-Tubes schließen perfekt ab und schützen vor Verdunstung.
  • Etikettieren Sie Ihre Proben mit unseren Barcode Labels. Bringen Sie das Etikett horizontal an
  • Verwenden Sie unsere Primer Barcodes für Ihre beigefügten Primer

 

 

 

Sequenzier-Primer


Profitieren Sie von größtmöglicher Flexibilität für Ihre Sequenzier-Primer

Dank unserer hauseigenen DNA-Synthese, unserer umfassenden Bioinformatik-und IT-Expertise haben Sie die freie Wahl, wie Sie uns Ihre Sequenzier-Primer zukommen lassen:

  • Wählen Sie einen unserer gelagerten Standard Primer
    Wählen und verwalten Sie Ihre bevorzugten Standard Primer aus einer Liste von 80 validierten Primern.
  • Bestellen Sie Ihre eigenen Sequenzier-Primer
    Bestellen Sie die Synthese benötigter Primer direkt zu Ihrer Sequenzierung. Um den NightXpress-Service nutzen zu können, muss die Bestellung bis 9:00 Uhr aufgegeben werden. Wir bewahren diese Primer 4 Wochen für Sie auf. In diesem Zeitraum können Sie sie jederzeit bequem wiederverwenden.
  • Schicken Sie uns Ihre eigenen Sequenzier-Primer
    Sie können uns Ihre Sequenzier-Primer in separaten 1.5 ml Tubes gemeinsam mit Ihren Proben schicken. Verwenden Sie dafür unsere kostenlosen Primer Barcodes.. Beigefügte Primer werden 10 Tage gelagert.
  • Voreingestellte Primer mit DNA-Template (für TubeSeq Supreme)
    Sie können Primer auch direkt zu Ihrem DNA-Template dazugeben und uns als DNA / Primer - Gemisch zu uns senden.


Bitte beachten Sie die optimalen Primerbedingungen, Konzentration und Volumen wie unten beschrieben.


Optimale Primer-Bedingungen:

  • Primer dürfen weder Phosphorylierung noch Fluoreszenzfarbstoffe enthalten
  • Die optimale Primerlänge liegt zwischen 16 und 25 Basen
  • Die Schmelztemperatur des Primers sollte 50 - 62°C betragen
  • Der GC-Gehalt des Primers sollte bei 35-60% liegen
  • Idealerweise sollte ein G oder C am 3’-Ende liegen
  • Die Anzahl der 3' Gs oder Cs sollte nicht größer als 2 Gs oder Cs sein
  • Wenn möglich, vermeiden Sie >3 identische Basen hintereinander in der Sequenz

 

Primer-Konzentration und -Volumen:

  • Pro Sequenzierreaktion werden exakt 10 pmol/µl Primer-Konzentration benötigt
  • Jeder Primer muss ein Gesamtvolumen von 20 µl (in bi-destilliertem Wasser oder 5mM Tris-HCl) haben; für jede weitere Sequenzierreaktion sind 2 µl Primer-Volumen erforderlich. 5 µl für den TubeSeq NightXpress.
  • Die Konzentration von Primern mit Wobbles muss nach folgender Formel berechnet werden: nX x ConcPrimer
    n = Anzahl Basen im Wobble gem. IUPC-Code, X = Anzahl Wobbles in der Primer-Sequenz. [e.g. 1 V (AGC) = 31 x 10 pmol/µl; 2 Y (CT) (CT) = 22 x 10 pmol/µl; 1 N (AGCT) = 41 x 10 pmol/µl ]

 

Aufbewahrung von Material- und Daten

 

Aufbewahrung von Proben und Primer:

  • Lagerung der DNA für 4 Wochen
  • Kostenlose Lagerung von synthetisierten Primern für 4 Wochen
  • Aufbewahrung von synthetisierten Primern für ein Jahr gegen Aufpreis
  • Kostenlose Lagerung von beigefügten Primern für 10 Tage
  • Aufbewahrung von beigefügten Primern für 6 Monate gegen Aufpreis

 

Datenspeicherung:

  • Sichere Online-Archivierung aller ausgewählten Sequenzdaten für 6 Monate

 

 

 

Prepaid Barcodes & Coupons


Profitieren Sie von einer Vielzahl von Online-Funktionen zur Verwaltung Ihrer Prepaid TubeSeq Supreme Barcode Labels und TubeSeq Coupons:

 


Sie bestimmen über die Nutzungsrechte

  • TubeSeq Supreme Barcodes können von jedem mit derselben Kundennummer verwendet werden
  • Sie können die Nutzungsrechte auf Ihren Account beschränken, indem Sie dies in Ihren Sequenzier-Einstellungen anwählen.
  • Wenn Sie Ihre TubeSeq Supreme Barcodes und TubeSeq Coupons mit bestimmten Kollegen teilen wollen, können Sie dies unter "Meine Gruppen" festlegen.
  • Alle Arten von Prepaid Tube Barcodes können auf jedes andere Konto unter "Meine Sanger Kits & Barcodes" übertragen werden.


Ihren Bestand haben Sie immer im Blick

  • Ihren aktuell verfügbaren Bestand sehen Sie unter "Meine Sanger Kits & Barcodes". Ampelfarben signalisieren Ihnen wenn Sie wieder nachbestellen sollten.
  • Sie können sich auch eine Erinnerung schicken lassen wenn Ihre Prepaid Barcode Etiketten zu Neige gehen. Die Anzahl, ab wann Sie informiert werden wollen, bestimmen Sie in Ihren "Sequenzier-Einstellungen". 


Status und Nutzer haben Sie im Überblick

  • Auf der "Meine Sanger Kits & Barcodes" Seite finden Sie in dem "Prepaid Tube Barcodes" Tab alle Details zu Ihren gekauften Prepaid Barcodes und Coupons.
  • Sie können dort nach bestimmten Barcodes suchen und nach Datum und Status sortieren.
  • Die Details, wann wer welche Barcodes verwendet hat und für welchen Auftrag, werden Ihnen angezeigt, wenn Sie mit Ihrer Maus auf die jeweilige Zeile gehen.

 

Alle Prepaid Barcodes, Kits und Coupons sind 5 Jahre lang gültig und verfallen erst nach 5 Jahren.

 

Haftungsausschluss für die Datenlieferung


Wichtige Information:


Die angegebenen Lieferzeiten hängen hauptsächlich von der Ankunftszeit der Proben im Labor ab.


Für viele europäische Städte bieten wir koordinierte Abhol- und Transportdienste mit Eurofins DropBoxen an, um eine pünktliche Lieferung im Labor zu gewährleisten.


Diese Logistikdienstleistungen können jedoch auch höherer Gewalt oder unvorhersehbaren Änderungen unterliegen, wie z.B. Streiks, Unfälle, Stürme, Überschwemmungen. In solchen Fällen kann Eurofins Genomics die angegebene Datenlieferzeit nicht garantieren und ist nicht verantwortlich für Verzögerungen, die durch Logistikdienste verursacht werden.


Zusätzlich gelten unsere Allgemeinen Geschäftsbedingungen (AGB).

 

 

 

Literatur

 

TubeSeq Supreme sample submission guide

Sequencing result guide

Free standard primers

DNA sequencing brochure

 

 

 

 

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