Wir stellen Rohdaten als FASTQ-Dateien für alle Projekte zur Verfügung. Darüber hinaus bieten wir fortgeschrittene bioinformatische Dienstleistungen an, die optional zur Datenanalyse genutzt werden können. Die verfügbaren bioinformatischen Dienstleistungen für RNA-Seq-Projekte sind wie folgt:

Standardanalyse:

• Qualitätsbewertung der Sequenzierungsdaten
• Ausrichtung der Reads auf ein Referenzgenom
• Assemblierung und Quantifizierung von Transkripten
• Normalisierung der Genanzahl
• Identifizierung von unterschiedlich exprimierten Genen
• Hauptkomponentenanalyse (PCA)
• Signifikanztests
• Erstellung detaillierter Berichte und Visualisierungen

Optionale Analyse:

• Analyse des alternativen Spleißens (AS)
• Genfusion-Analyse
• Varianten-Erkennung und deren Auswirkungen auf Proteinveränderungen

Erweiterte Analyse:

• Gen-Set-Anreicherungsanalyse (GSEA)

Jeder Service umfasst spezifische Ergebnisse und hat damit verbundene Kosten und Bearbeitungszeiten.