Design Tools für perfekte PCR - und Sequenzierprimer
Eurofins Genomics' Primer Design Tools verwenden das Prime+ Programm des GCG Wisconsin Package das ursprünglich von Irv Edelman geschrieben wurde.
Mit Prime+ nutzen Sie eines der besten Sequenzanalyse-Programme die es für das Design von PCR Primern und Primer für die DNA Sequenzierung gibt.
Bei dem PCR Primer Design können Sie eine gezielte Region wählen die amplifiziert werden soll. Bei dem Sequenzier-Primer Design definieren Sie Positionen auf der Template-DNA, die in der Sequenzierung enthalten sein müssen.
Zur Ermittlung der optimalen Primer müssen bestimmte Parameter für Primer und Amplikon berücksichtigt werden. Die optimalen Werte dieser Parameter sind in unseren Design Tools vordefiniert:
- Physikalische Eigenschaften der PCR Primer
Optimale Primer-Länge, G/C als 3’ Basen, GC-Gehalt und Tm der Primer.
- Optimale Parameter für das PCR Primer-Paar
Tm-Differenz zwischen beiden Primern, Repeats und optimales Primer-Primer Annealing
- Physikalische Eigenschaften des PCR Produkts
GC-Gehalt und Tm-Bereich des PCR Produkts, Repeats und optimales Primer-Template Annealing
Für eine effiziente Primer-Bindung, vermeidet das Tool das Design von Primer-Sequenzen mit Hang zu extensiven Self-Dimer und Cross-Dimer Bildungen um Sekundärstrukturen sowie Primer-Dimere zu verhindern.
Die Primer werden nach den erwarteten Leistungskriterien in der Ergebnisliste angezeigt. Die ausgewählten Primer können Sie direkt in Ihrem Einkaufswagen speichern.