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Sanger Sequencing

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Genotyping & Gene Expression

 

 

Der TubeSeq Service ist der Sanger-Sequenzier-Service der Extraklasse

 

 

Hier wird Automatisierung mit langjähriger Erfahrung und Flexibilität vereint.

 


Der TubeSeq Service von Eurofins Genomics ist eine Kombination aus hoher Automatisierung und langjähriger Erfahrung im Umgang mit Proben die speziellere Lösungen erfordern.

 

 

 

 

 

 

Die Highlights des TubeSeq Service sind:

 

  • Bis zu 8 Reaktionen pro Probe können spezifiziert werden
  • Die Sequenzierung kann mit TubeSeq Labels und mit TubeSeq Coupons bezahlt werden
  • Alle Probenarten, inkl. große Fragmente, werden sequenziert
  • Die Konzentrationseinstellung Ihrer DNA ist zusätzlich wählbar
  • Sequenzierung schwieriger Templates mit dem Power Read*
  • Ergebnisse erhalten Sie ab nächsten Tag nach Probeneingang

Alle Vorteile unseres TubeSeq Service auf einen Blick:

 

  • Sie erhalten Leseweiten von bis zu 1.100 Basen
  • Q20-, Q30- oder Q40 Daten sind kostenfrei auswählbar
  • Dateiformate der Sequenzierergebnisse sind pro Auftrag wählbar
  • Sichere Online-Archivierung und Zugriff auf Ihre Daten
  • Eine kostenlose Wiederholung bei technischen Ursachen ist inklusive
  • Lagerung der DNA und synthetisierten Primern für 4 Wochen
  • Synthetisierte Primer werden auf Anfrage für 1 Jahr gelagert
  • Nachbestellung von bis zu 8 Reaktionen aus gelagerter DNA möglich

 

 

 

 

 

Weiterführende Informationen

 

Probenvorbereitung

Bitte liefern Sie uns Ihre Proben in Konzentration und Volumen wie folgt:

Probenart
Produktlänge
Konzentration.
Vol. 1-4 Rkt.
Vol. 5-8 Rkt.
Plasmid DNA < 30 kbp 50-100 ng/µl 15 µl 20 µl
BAC/PAC/Cosmid DNA 30 - 200 kbp 200-1000 ng/µl 15 µl 20 µl
Gereinigte PCR Produkte 150-300 bp 1 ng/µl 15 µl 20 µl
  300-1000 bp 5 ng/µl 15 µl 20 µl
  1000-3000 bp 10 ng/µl 15 µl 20 µl
Ungerreinigte PCR Produkte 150-300 bp 4 ng/µl 15 µl 20 µl
  300-1000 bp 10 ng/µl 15 µl 20 µl
  1000-3000 bp 20 ng/µl 15 µl 20 µl


Premixed Proben (Mischung aus DNA und Primer):

  • Templates sollten aus 15 µl aufgereinigter DNA in einer der in der obigen Tabelle angegebenen Konzentrationen bestehen
  • Fügen Sie 2 µl Primer mit einer Konzentration von 10 pmol/µl (10 µM) hinzu
  • Das Gesamtvolumen Ihrer voreingestellten Probe muss 17 µl betragen

 

 

 

Probenversand


Bitte senden Sie uns Ihre Proben ausschließlich wie unten beschrieben; das hilft uns dabei, Ihnen schnelle und präzise Ergebnisse zu liefern.

 

  • Verwenden Sie 1,5ml „Safe Lock“-Tubes für Ihre Templates und Primer
  • Verkleben oder umwickeln Sie Ihre Tubes nicht mit Parafilm. „Safe Lock“-Tubes sind viel besser geeignet, denn sie schließen perfekt ab und schützen vor Verdunstung.
  • Etikettieren Sie Ihre Proben mit unseren Barcode Labels. TubeSeq Labels (Prepaid) oder unseren kostenlosen TubeLabels.
  • Nutzen Sie unsere TubeSeq Coupons um für zusätzliche Reaktionen zu bezahlen
  • Verwenden Sie wasserfesten Marker für alle zusätzlichen Kennzeichnungen auf Ihren Tubes

 

 

 

1

Only use 1.5 ml
safe-lock tubes

 

2

Remove barcode
stricker from film

 

3

Affix barcode sticker
horizontally

 

4

QR-code visible at front so
it can be read by scaner

Sequenzier-Primer

Profitieren Sie von größtmöglicher Flexibilität für Ihre Sequenzier-Primer

Dank unserer hauseigenen DNA-Synthese, unserer umfassenden Bioinformatik-und IT-Expertise haben Sie die freie Wahl, wie Sie uns Ihre Sequenzier-Primer zukommen lassen:

  • Mehr als 80 Standard Primer stehen Ihnen zur Verfügung
    Wählen und verwalten Sie Ihre bevorzugten Standard Primer aus einer Liste von 80 validierten Primern.
  • Designen Sie Ihre eigenen Sequenzier-Primer
    Verwenden Sie unser Sequenzier Primer Design Tool für Ihre forward und reverse Primer die Sie anschließen einfach bestellen können.
  • Bestellen Sie Ihre eigenen Sequenzier-Primer
    Bestellen Sie die Synthese benötigter Primer direkt zu Ihrer Sequenzierung. Wir bewahren diese Primer 4 Wochen für Sie auf. In diesem Zeitraum können Sie sie jederzeit bequem wiederverwenden.
  • Schicken Sie uns Ihre eigenen Sequenzier-Primer
    Sie können uns Ihre Sequenzier-Primer in separaten Tubes gemeinsam mit Ihrer Proben schicken. Verwenden Sie dafür unsere kostenlosen Primer Barcodes.*
  • Voreingestellte Primer mit DNA-Template
    Sie können Primer auch direkt zu Ihrem DNA-Template dazugeben und uns als DNA / Primer - Gemisch für den TubeSeq ServiceMix2Seq, LightRun Tube, LightRun Plate und den PlateSeq Service senden.

 


Bitte beachten Sie die optimalen Primerbedingungen, Konzentration und Volumen wie unten beschrieben.

Optimale Primer-Bedingungen:

  • Primer dürfen weder Phosphorylierung noch Fluoreszenzfarbstoffe enthalten
  • Die optimale Primerlänge liegt zwischen 16 und 25 Basen
  • Die Schmelztemperatur des Primers sollte 50 - 62°C betragen
  • Der GC-Gehalt des Primers sollte bei 35-60% liegen
  • Idealerweise sollte ein G oder C am 3’-Ende liegen
  • Die Anzahl der 3' Gs oder Cs sollte nicht größer als 2 Gs oder Cs sein
  • Wenn möglich, vermeiden Sie >3 identische Basen hintereinander in der Sequenz


Primer-Konzentration und -Volumen:

  • Pro Sequenzierreaktion werden exakt 10 pmol/µl Primer-Konzentration benötigt
  • Jeder Primer muss ein Gesamtvolumen von 15 µl (in bi-destilliertem Wasser oder 5mM Tris-HCl) haben; für jede weitere Sequenzierreaktion sind 5 µl Primer-Volumen erforderlich
  • Die Konzentration von Primern mit Wobbles muss nach folgender Formel berechnet werden: nX x ConcPrimer

    n = Anzahl Basen im Wobble gem. IUPC-Code, X = Anzahl Wobbles in der Primer-Sequenz. [z.B. 1 V (AGC) = 31 x 10 pmol/µl; 2 V (AGC) (AGC) = 32 x10 pmol/µl]

 *: Bereits vorhandene Tube Labels können weiterhin für mitgesendete Primer verwendet werden

Aufbewahrungszeiten

 

Aufbewahrung von Proben und Primer:

  • Lagerung der DNA für 4 Wochen
  • Kostenlose Lagerung der synthetisierten Primer für 4 Wochen
  • Aufbewahrung von synthetisierten Primern für ein Jahr gegen Aufpreis

 

Datenspeicherung:

  • Sichere Online-Archivierung aller ausgewählten Sequenzdaten für 6 Monate
    (Bei Bestellungen die in Ebersberg bearbeitet werden, werden die Daten 3 Monate gespeichert)

TubeSeq Labels & Coupons

So komfortabel war die DNA Sequenzierung noch nie!


Kleben Sie einfach ein TubeSeq Label auf Ihr Probenröhrchen und geben Sie den Barcode ein, um Ihre Probe zu identifizieren. Nutzen Sie bequem unsere TubeSeq Coupons, um zusätzliche Reaktionen zu bezahlen. Des Weiteren profitieren Sie von einer Vielzahl von komfortablen Online-Funktionalitäten rund um Ihre TubeSeq Labels und TubeSeq Coupons:


Sie bestimmen über die Nutzungsrechte

  • TubeSeq Labels können von jedem mit derselben Kundennummer verwendet werden
  • Sie können die Nutzungsrechte auf Ihren Account beschränken, indem Sie dies in Ihren Sequenzier-Einstellungen anwählen.
  • Wenn Sie Ihre TubeSeq Labels oder TubeSeq Coupons mit bestimmten Kollegen teilen wollen, können Sie dies unter "Meine Gruppen" festlegen.
  • TubeSeq Labels und TubeSeq Coupons können auf jedes andere Konto unter "Meine Sanger Kits & Barcodes" übertragen werden.


Ihren Bestand haben Sie immer im Blick

  • Ihren aktuell verfügbaren Bestand sehen Sie unter "Meine Sanger Kits & Barcodes". Ampelfarben signalisieren Ihnen wenn Sie wieder nachbestellen sollten.
  • Sie können sich auch eine Erinnerung schicken lassen wenn Ihre TubeSeq Labels zu Neige gehen. Die Anzahl, ab wann Sie informiert werden wollen, bestimmen Sie in Ihren "Sequenzier-Einstellungen". 


Status und Nutzer haben Sie im Überblick

  • Auf der "Meine Sanger Kits & Barcodes" Seite finden Sie in dem "Prepaid Tube Barcodes" Tab alle Details zu Ihren gekauften TubeSeq Labels und TubeSeq Coupons.
  • Sie können dort nach bestimmten Barcodes suchen und nach Datum und Status sortieren.
  • Die Details, wann wer welche Barcodes verwendet hat und für welchen Auftrag, werden Ihnen angezeigt, wenn Sie mit Ihrer Maus auf die jeweilige Zeile gehen.

 

 

Power Read Upgrade

Wann Sie den Power Read wählen sollten

Falls die Sequenz Ihrer Proben >30 kbp groß ist, oder Abschnitte hat die sich eventuell schwer sequenzieren lassen, wählen Sie unseren Power Read Upgrade. Wir führen spezielle Sequenzierkonditionen oder nutzen spezielle Chemie um die bestmöglichen Ergebnisse zu erzielen. Eine kostenlose Wiederholung ist mit inbegriffen. Dieser Service erfordert eine längere Bearbeitungszeit.

 

 

 

 

Literatur

 

 

 

 

 

 

 

 

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Qualität ist uns sehr wichtig

Unsere Produkte und Services werden unter strengen Qualitätsrichtlinien produziert und durchgeführt.

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