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Wann sollte ich den Custom Long-Read Amplicon Sequencing Service anstelle des ONT Lite Clonal Amplicon Sequencing Service verwenden?
Das Custom Long-Read Amplicon Sequencing widmet Ihren Amplicons eine ganze Flow-Zelle. Dadurch ist diese Methode zeitaufwendiger und kostspieliger im Vergleich zum ONT Lite Clonal Amplicon Sequencing Service, aber sie ist in den folgenden Fällen besonders geeignet:
- Wenn Sie zusätzliche Dienste wie 16S Mikrobiom-Analyse, Unique Sequence Analysis, Variant Analysis, Sequence Cleaning, Host Removal oder die Lieferung von Pod5-Rohdaten benötigen.
- Wenn Ihre lineare DNA-Probe nicht klonal ist, sondern eine Mischung verschiedener Moleküle enthält.
- Wenn vollständige, end-to-end Reads ohne Fragmentierung erforderlich sind.
- Wenn eine höhere Anzahl an Sequenzier-Reads benötigt wird, die über das typische Output des ONT Lite Clonal Amplicon Sequencing Service hinausgeht.
- Wenn Sie alle Roh-Reads erhalten möchten, die aus Ihrer Probe generiert wurden.
Wie sollte ich meine Amplicons reinigen?
Wir empfehlen, Ihre Amplicons mit kommerziell erhältlichen Kits auf Basis von DNA-bindenden Beads oder Säulen oder durch enzymatische Reinigung zu reinigen. Bitte schicken Sie keine Primer mit Ihren Proben oder vermischt in Ihren Proben.
Welche Arten von Proben können für die Amplicon-Sequenzierung eingereicht werden?
Reichen Sie gereinigte PCR-Produkte mit einer Größe von 500 bp bis 25 kb ein. Die Amplicons sollten idealerweise eine einzelne Bande auf einem Gel erzeugen, um optimale Ergebnisse zu erzielen.
Führt Eurofins Genomics eine Qualitätskontrolle (QC) an meinen Proben vor der Bibliotheksvorbereitung durch?
Ja, wir führen eine Qualitätskontrolle der Menge der Amplicons durch